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Enregistrement W2316273454 · doi:10.1016/j.neps.2016.03.001

The impact on nitrogen-efficient phenotypes when aspartate aminotransferase is expressed tissue-specifically in Brassica napus

2016· article· en· W2316273454 sur OpenAlexafffund
Chandra H. McAllister, Mark Wolansky, Allen G. Good

Notice bibliographique

RevueNew Negatives in Plant Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesGenome Canada
Mots-clésBrassicaPhenotypeNitrogenBiologyGeneticsGeneBotanyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aspartate aminotransferase (AAT) catalyzes a reversible transamination reaction, producing aspartate and 2-oxoglutarate from glutamate and oxaloacetate, in various cellular plant compartments. Previous work in our lab had shown that a similar aminotransferase enzyme, alanine aminotransferase (AlaAT), produced nitrogen use efficient (NUE) phenotypes when over-expressed in canola (Brassica napus) under the salt-stress inducible promoter, btg-26. Given the similarities between these two enzymes and their roles in plant metabolism, it was hypothesized that over-expression of AAT could also produce an NUE phenotype in canola. Transgenic Brassica napus lines over-expressing AAT from Medicago sativa were produced and analyzed for NUE phenotypes under both high and low nitrogen conditions. While several lines showed promising increases in biomass under the various fertilizer regimes, these alterations could not be reliably replicated and increases in expression of the transgene detected via RT-PCR did not translate into significant increases in AAT activity in plant tissues. Transgenic Brassica napus lines over-expressing AAT do not display NUE phenotypes similar to those plants over-expressing AlaAT. Although this work produced a negative result, it is important to compare the NUE phenotype produced by over-expression of AlaAT and AAT, and differences in metabolism between AAT vs AlaAT over-expressing lines which may be used to deduce changes in plant N metabolism important for NUE in cereal crops.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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