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Enregistrement W2316374739 · doi:10.1136/sextrans-2011-050108.523

P4-S3.08 Development of a novel chimeric protein construct for improved diagnosis of syphilis

2011· article· en· W2316374739 sur OpenAlexaff
Brenden C. Smith, Caroline E. Cameron

Notice bibliographique

RevueSexually Transmitted Infections · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Biosensing Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSyphilisMedicineChimera (genetics)NeurosyphilisFusion proteinImmunologyPoint-of-care testingSyphilis SerodiagnosisImmunoassayLatent SyphilisVirologyAntibodyBiologyRecombinant DNAHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives To develop a novel diagnostic protein in order to enhance early detection of syphilis infections and improve overall syphilis diagnosis. Methods Using pooled serum samples from patients infected with syphilis, immunoreactive regions of two previously identified diagnostic protein candidates, Tp0326 and Tp0453, were elucidated. Focusing on these regions, a chimeric protein construct was created for expression inEscherichia coliand expression conditions were optimised to produce soluble protein expression. This Tp0326/Tp0453 chimeric construct was screened against serum samples from; patients with primary, secondary, latent, and neurosyphilis and uninfected individuals. These results were directly compared to the rapid plasma regain (RPR) test, and the microhemagglutination assay forT pallidum(MHA-TP). Results Screening results show high degrees of sensitivity and specificity for the Tp0326/Tp0453 chimeric construct, identifying all stages of syphilis infection from early primary to late latent. Conclusion The Tp0326/Tp0453 chimera shows promise as a new diagnostic antigen for detecting all stages of syphilis infection and for development into point-of-care diagnostic test formats.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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