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Enregistrement W2316534637 · doi:10.1021/bc200229y

Use of 5′-γ-Ferrocenyl Adenosine Triphosphate (Fc-ATP) Bioconjugates Having Poly(ethylene glycol) Spacers in Kinase-Catalyzed Phosphorylations

2011· article· en· W2316534637 sur OpenAlexaff
Sanela Martić, Meghan K. Rains, Daniel J. Freeman, Heinz‐Bernhard Kraatz

Notice bibliographique

RevueBioconjugate Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryProtein kinase AEthylene glycolAdenosine triphosphateKinaseBiochemistryCasein kinase 2Cyclin-dependent kinase 2BiophysicsOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 5'-γ-ferrocenyl adenosine triphosphate (Fc-ATP) bioconjugates (3 and 4), containing the poly(ethylene glycol) spacers, were synthesized and compared to a hydrophobic analogue as co-substrates for the following protein kinases: sarcoma related kinase (Src), cyclin-dependent kinase (CDK), casein kinase II (CK2α), and protein kinase A (PKA). Electrochemical kinase assays indicate that the hydrophobic Fc-ATP analogue was an optimal co-substrate for which K(M) values were determined to be in the 30-200 μM range, depending on the particular protein kinase. The luminescence kinase assay demonstrated the kinase utility for all Fc-ATP conjugates, which is in line with the electrochemical data. Moreover, Fc-ATP bioconjugates exhibit competitive behavior with respect to ATP. Relatively poor performance of the polar Fc-ATP bioconjugates as co-substrates for protein kinases was presumably due to the additional H-bonding and electrostatic interactions of the poly(ethylene glycol) linkers of Fc-ATP with the kinase catalytic site and the target peptides. Phosphorylation of the full-length protein, His-tagged pro-caspase-3, was demonstrated through Fc-phosphoamide transfer to the Ser residues of the surface-bound protein by electrochemical means. These results suggest that electrochemical detection of the peptide and protein Fc-phosphorylation via tailored Fc-ATP co-substrates may be useful for probing protein-protein interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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