Extracting Kinetics from Affinity Capillary Electrophoresis (ACE) Data: A New Blade for the Old Tool
Notice bibliographique
Résumé
We describe a mathematical approach that enables extraction of kinetic rate constants from thousands of studies conducted over the past two decades with affinity capillary electrophoresis (ACE). Previously, ACE has been used almost exclusively for obtaining equilibrium constants of intermolecular interactions. In this article, we prove that there exists an analytical solution of partial differential equations describing mass transfer in ACE. By using an in silico study, we demonstrate that the solution is applicable to experimental conditions that are typically used in ACE and found in most historical ACE experiments. The solution was validated by extracting rate constants from previously published ACE data and closely matching independently obtained results. Lastly, it was used to obtain previously unknown rate constants from historical ACE data. The new mathematical approach expands the applicability of ACE to a wider range of biomolecular interactions and enables both prospective and retrospective data analysis. The obtained kinetic information will be of significant practical value to the fields of pharmacology and molecular biology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,015 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,004 | 0,007 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,006 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».