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Enregistrement W2316740619 · doi:10.1021/la503867h

Structure and Binding of the C-Terminal Segment of R9AP to Lipid Monolayers

2015· article· en· W2316740619 sur OpenAlexafffund
Sarah C. Bernier, Habib Horchani, Christian Salesse

Notice bibliographique

RevueLangmuir · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTransducinVisual phototransductionChemistryMembraneRhodopsinBiophysicsPhospholipidCircular dichroismProtein secondary structureTransmembrane proteinCrystallographyBiochemistryRetinalBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phototransduction cascade takes place in disc membranes of photoreceptor cells. Following its activation by light, rhodopsin activates the G-protein transducin causing the dissociation of its GTP-bound α-subunit, which in turn activates phosphodiesterase 6 (PDE6) leading to the hyperpolarization of photoreceptor cells. PDE6 must then be inactivated to return to the dark state. This is achieved by a protein complex which is presumably anchored to photoreceptor disc membranes by means of the transmembrane C-terminal segment of RGS9-1-Anchor Protein (R9AP). Information on the secondary structure and membrane binding properties of the C-terminal segment of R9AP is not yet available to further support its role in the membrane anchoring of this protein. In the present study, circular dichroism and infrared spectroscopy measurements have allowed us to determine that the C-terminal segment of human and bovine R9AP adopts an α-helical structure in solution. Moreover, this C-terminal segment has shown affinity for most of the phospholipids typical of photoreceptor membranes. In fact, the physical state and the type of phospholipid as well as electrostatic interactions influence the binding of the human and bovine peptides to phospholipid monolayers. In addition, these measurements revealed that the human peptide has a high affinity for saturated phosphocholine, which may suggest a possible localization of R9AP in photoreceptor microdomains. Accordingly, infrared spectroscopy measurements have allowed determining that the C-terminal segment of R9AP adopts an ordered α-helical structure in the presence of saturated phospholipid monolayers. Altogether, these data are consistent with the typical α-helical secondary structure and behavior observed for transmembrane segments and with the proposed role of membrane anchoring of the C-terminal segment of human and bovine R9AP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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