Abstract 1362: Developing genetically flexible mouse models of sarcoma - a novel functional genomics platform
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction: Sarcomas are a heterogeneous group of malignant neoplasms that arise from connective tissues and have a disease-specific mortality of 30-50%. Existing mouse models of sarcomagenesis utilize knockout and transgenic mice but it is unclear if fixed germline mutations recapitulate sporadic human cancer. In addition, creating germline mutant mice requires substantial time and resources. We hypothesized that delivery of oncogenes into mouse skeletal muscle using a retroviral (RCAS) system would result in sarcomagenesis and could mitigate the limitations of conventional mouse models. Methods: p16/p19 null mice expressing the retroviral receptor, TVA, under nestin (N-tva) or β-actin (BKE) promoters were used. DF1 chicken fibroblasts, infected with avian-leukosis virus vectors (RCAS) carrying combinations of oncogenes (KrasG12D, c-Myc, IGF2) or GFP alone, were delivered by injection into the hindlegs of neonatal mice and tumor development was monitored. Results: GFP-positive cells were observed following in vitro infection of cultured mouse skeletal muscle with RCAS-GFP and GFP+ myoblasts were identified from mice injected with RCAS-GFP in vivo, suggesting successful cell infection and targeted gene delivery. Sarcomas formed in 30% of p16/p19−/−xN-tva mice at the injection site with a median latency of 23.5 weeks (8-42 weeks). Several subtypes of sarcoma developed in this strain based on morphologic assessment and immunohistochemistry (S100, desmin, and smooth muscle actin). Of these, malignant peripheral nerve sheath tumor (MPNST) that overexpressed EGFR consistent with human MPNST, was the predominant subtype (55%). Although a similar tumor incidence occurred in the p16/p19−/−xBKE strain (32%), the median latency was much shorter, 10.4 weeks (7-25 weeks) and the tumor spectrum shifted to predominantly fibrosarcoma (36%) or rhabdomyosarcoma (36%). No tumors were observed in mice injected with empty RCAS vector or without inactivation of the p16/p19 locus. Gene-anchored PCR revealed retroviral vector DNA integration in 89% of N-tva and 97% of BKE tumors. KrasG12D was the most frequent oncogene isolated. Conclusions: We have generated novel models of sarcomagenesis using the RCAS-TVA system to deliver known sarcoma oncogenes into mouse hind legs with a tumor incidence of ∼30%. With optimization, we will be able to use this genetically flexible system to functionally validate novel candidate sarcoma genes. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 1362. doi:1538-7445.AM2012-1362
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».