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Enregistrement W2316751273 · doi:10.1158/1538-7445.am2012-1362

Abstract 1362: Developing genetically flexible mouse models of sarcoma - a novel functional genomics platform

2012· article· en· W2316751273 sur OpenAlexaff
Amar Gupta, Serena Menezes, Leah Kabaroff, Brendan C. Dickson, Carol J. Swallow, Rebecca A. Gladdy

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGermlineSarcomaSkeletal muscleCancer researchTransgeneGenetically modified mouseDesminGreen fluorescent proteinPathologyImmunohistochemistryImmunologyMedicineGeneticsGeneVimentinEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: Sarcomas are a heterogeneous group of malignant neoplasms that arise from connective tissues and have a disease-specific mortality of 30-50%. Existing mouse models of sarcomagenesis utilize knockout and transgenic mice but it is unclear if fixed germline mutations recapitulate sporadic human cancer. In addition, creating germline mutant mice requires substantial time and resources. We hypothesized that delivery of oncogenes into mouse skeletal muscle using a retroviral (RCAS) system would result in sarcomagenesis and could mitigate the limitations of conventional mouse models. Methods: p16/p19 null mice expressing the retroviral receptor, TVA, under nestin (N-tva) or β-actin (BKE) promoters were used. DF1 chicken fibroblasts, infected with avian-leukosis virus vectors (RCAS) carrying combinations of oncogenes (KrasG12D, c-Myc, IGF2) or GFP alone, were delivered by injection into the hindlegs of neonatal mice and tumor development was monitored. Results: GFP-positive cells were observed following in vitro infection of cultured mouse skeletal muscle with RCAS-GFP and GFP+ myoblasts were identified from mice injected with RCAS-GFP in vivo, suggesting successful cell infection and targeted gene delivery. Sarcomas formed in 30% of p16/p19−/−xN-tva mice at the injection site with a median latency of 23.5 weeks (8-42 weeks). Several subtypes of sarcoma developed in this strain based on morphologic assessment and immunohistochemistry (S100, desmin, and smooth muscle actin). Of these, malignant peripheral nerve sheath tumor (MPNST) that overexpressed EGFR consistent with human MPNST, was the predominant subtype (55%). Although a similar tumor incidence occurred in the p16/p19−/−xBKE strain (32%), the median latency was much shorter, 10.4 weeks (7-25 weeks) and the tumor spectrum shifted to predominantly fibrosarcoma (36%) or rhabdomyosarcoma (36%). No tumors were observed in mice injected with empty RCAS vector or without inactivation of the p16/p19 locus. Gene-anchored PCR revealed retroviral vector DNA integration in 89% of N-tva and 97% of BKE tumors. KrasG12D was the most frequent oncogene isolated. Conclusions: We have generated novel models of sarcomagenesis using the RCAS-TVA system to deliver known sarcoma oncogenes into mouse hind legs with a tumor incidence of ∼30%. With optimization, we will be able to use this genetically flexible system to functionally validate novel candidate sarcoma genes. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 1362. doi:1538-7445.AM2012-1362

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,275
Tête enseignante GPT0,421
Écart entre enseignants0,145 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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