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Enregistrement W2316766144 · doi:10.1097/pai.0b013e3182810b8e

Predicting OncoDx Recurrence Scores With Immunohistochemical Markers

2013· article· en· W2316766144 sur OpenAlexaff
Scott H. Bradshaw, Dale Pidutti, Denis Gravel, Xinni Song, Esmeralda Celia Marginean, Susan J. Robertson

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensCarleton UniversityOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunohistochemistryMedicineInternal medicineOncologyBreast cancerPopulationCohortCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent reports suggest that immunohistochemistry (IHC) markers can be used to give prognostic information in breast cancer that is similar to that contained in the Genomic Health Inc. OncoDx recurrence score (Onco-RS). The goal of this study is to examine the potential prognostic value of a score derived from results of a simple set of IHC tests in the prediction of the Onco-RS. A score (IHC-RS) was derived to predict the Onco-RS using IHC-based quantitative and semiquantitative results from a subset of markers selected from those used in the generation of an Onco-RS score. The patient population consists of a retrospectively identified cohort of 158 women with ER-positive, HER2neu-negative breast cancer who completed OncoDx testing. A predictive model was developed to generate the IHC-RS using stepwise multiple regression incorporating Ki67 percentage and semiquantitative ER and PR scores. Using only these 3 IHC markers, the IHC-RS predicted 62% of the Onco-RS variability (adjusted R=0.624, P=0.004). In addition, analysis of outliers in the correlation between the IHC-RS and the Onco-RS reveals the possibility of sampling error as a drawback of the Onco-RS. This is contrasted against potential interlab and intralab variability and preanalytic issues that may negatively impact the implementation of an IHC-RS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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