Positional Impact of Fluorescently Modified G-Tetrads within Polymorphic Human Telomeric G-Quadruplex Structures
Notice bibliographique
Résumé
Emissive C8-aryl-2'-deoxyguanosines placed within G-tetrads of G-quadruplex structures are useful probes for distinguishing G-quadruplexes from duplex structures using fluorescence spectroscopy. Here, we report the positional impact of C8-furyl-dG ((Fur)dG) on G-quadruplex folding in the human telomere 22-mer oligonucleotide (HTelo22, (d[AG3(T2AG3)3])). The (Fur)dG probe was inserted into four different positions within the three unique G-tetrads of HTelo22, and G-quadruplex folding was monitored by UV-vis thermal denaturation, circular dichroism, and fluorescence spectroscopy. Our studies demonstrate the impacts of C8-aryl-dG adduct formation on G-quadruplex polymorphism in K(+) solution and in the presence of the additives and cosolutes, CH3CN, polyethylene glycol (PEG-600), and N-methyl mesoporphyrin IX (NMM). Our experiments predict that C8-aryl-dG derivatives can serve as useful tools for various in vitro studies aimed at understanding both the implications of DNA adduct formation within G-quadruplex structures and the unique implications imposed by various folding topologies on biological function/recognition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».