MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2317261265 · doi:10.1080/14620316.2007.11512297

Inter-simple sequence repeat (ISSR)-PCR analysis to assess genetic diversity in a collection of wild cloudberry (<i>Rubus chamaemorus</i>L.) clones

2007· article· en· W2317261265 sur OpenAlexaffabout
Samir C. Debnath

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Horticultural Science and Biotechnology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBerry genetics and cultivation research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenetic diversityBiologyUPGMAGenetic variationGermplasmAnalysis of molecular varianceGenetic variabilityMicrosatelliteGeneticsBotanyGenotypeGenetic structureAllelePopulationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SummaryForty-eight wild cloudberry (Rubus chamaemorus L.) clones, collected from four Canadian Provinces, were assessed for genetic variability using inter-simple sequence repeat (ISSR)-PCR methods. Nine primers generated 138 polymorphic ISSR bands. A substantial degree of genetic diversity was found among the wild collection. Cluster analysis by the unweighted pair-group method with arithmetic averages (UPGMA) separated the 48 wild clones into six main clusters, and identified the one remaining clone as an outlier. Furthermore, within four of the clusters, the clones tended to form sub-clusters that were in agreement with a principal coordinate (PCO) analysis. Geographical distribution explained 8% of the total variation revealed by analysis of molecular variance (AMOVA). The ISSR markers detected a sufficient degree of polymorphism to differentiate among cloudberry clones, making this technology valuable for germplasm management, and more efficient choices of parents in current cloudberry breeding programmes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,802
Score d'incertitude au seuil0,300

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,004
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Horticultural Science and BiotechnologyMême sujetBerry genetics and cultivation researchTravaux en français237 207