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Enregistrement W2317503011 · doi:10.1158/1538-7445.am10-4355

Abstract 4355: The C19MC miRNA polycistron are frequent targets of gene amplification in aggressive primitive neuroectodermal brain tumors and encode oncogenic miRNAs that inhibit normal neural stem cell differentiation

2010· article· en· W2317503011 sur OpenAlexaff
Meihua Li, Kyle Lee, Yuntao Lu, Ian D. Clarke, David Shih, Timothy Van Meter, Limei Zhou, Daniel Picard, Piergiorgio Modena, Scott L. Pomeroy, Ching C. Lau, Micheal D. Taylor, Éric Bouffet, James T. Rutka, Amar Gajjar, Peter B. Dirks, Cynthia Hawkins, Annie Huang

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaBiologymicroRNACancer researchGenePrimitive neuroectodermal tumorStem cellNeural stem cellPathologyGeneticsImmunohistochemistryImmunologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Embryonal brain tumors which include medulloblastoma and primitive neuroectodermal brain tumors (CNS-PNET) comprise the largest group of malignant pediatric brain tumors and account for substantial cancer related morbidity and mortality in childhood. Unlike medulloblastoma, a common, cerebellar PNET, few CNS-PNET arising in extracerebellar locations have been characterized. Lack of insight into the molecular pathogenesis of CNS-PNET is a major obstacle towards development of much-needed disease-specific models and treatments for these devastating tumors. In this study, we performed high-resolution DNA copy number analysis on a substantial collection of primary CNS-PNET obtained through an international collaborative group, and discovered a frequent amplicon in 25% (11/46) of CNS-PNET which span 34 protein coding genes and two miRNA clusters, C19MC and miR-371-373, on chr19q13.41. Detailed mapping studies revealed C19MC, which encode 54 primate-specific miRNAs, as the specific target of gene amplification resulting in striking tumor-specific overexpression of a sub-set of miRNAs, including miR-520 g and miR- 517c. Stable expression of miR-520 g and miR-517c promoted in vitro and in vivo oncogenicity and conferred cell survival in tumor cell lines. Strikingly expression of both miR-520g and 517c promoted growth and inhibited differentiation of untransformed normal human neural stem cells. Notably, clinicopathologic analyses revealed that C19MC amplification identifies a distinct group of CNS-PNET with similar gene expression profiles, characteristic histology, and much poorer survival. Our aggregate findings which point to C19MC as an important, new oncogenic locus in a human cancer, have significant implications for the diagnosis and clinical management of embryonal brain tumors in children. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 4355.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
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