IRMPD Spectroscopic Study of Microsolvated [Na(GlyAla)]<sup>+</sup> and [Ca(GlyAla–H)]<sup>+</sup> and the Blue Shifting of the Hydrogen-Bonded Amide Stretch with Each Water Addition
Notice bibliographique
Résumé
In this study, the structures of [Na(GlyAla)(H2O)](+) and [Ca(GlyAla-H)(H2O)n](+), (n = 1-3) solvated ion-molecule complexes (as well as the AlaGly isomers) were investigated using infrared multiple photon dissociation (IRMPD) spectroscopy and with computational methods. Calculations showed that in the calcium clusters, the lowest-energy complex is the one in which the peptide is deprotonated at the carboxylic acid end and that Ca(2+) binds to both carboxylate oxygen atoms as well as the amide carbonyl oxygen. For the microsolvated structures, all three water molecules also bind directly to Ca(2+). For the singly, doubly, and triply solvated complexes, these structures are supported by experimental IRMPD spectra. For the [Na(GlyAla)(H2O)](+) complex, both carbonyl oxygen atoms, one from the intact carboxylic acid and one from the amide group, as well as the water molecule were found to be bound to the Na(+). In all of the spectra, a strong band is observed between 3300 and 3400 cm(-1) and is assigned to the amide N-H stretch, which is red-shifted due to hydrogen bonding with the amine nitrogen. The position of the hydrogen-bonded amide N-H stretch is experimentally and theoretically found to be sensitive to the number of water molecules; it is shown to blue shift upon successive hydrations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».