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Enregistrement W2317997914 · doi:10.1158/0008-5472.sabcs-3063

Synthetic lethality when combining phosphoinositide 3-kinase alpha and beta catalytic subunit-directed RNAi and estrogen deprivation for estrogen receptor positive breast cancer: implications for clinical trial design with pharmacological inhibitors.

2009· article· en· W2317997914 sur OpenAlexaff
RJ Crowder, Chanpheng Phommaly, Jeremy Hoog, Yi-Ming Tao, Anthony J. Saporita, JD Weber, DG Huntsman, MJ Ellis

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePI3K/AKT/mTOR signaling in cancer
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchGene knockdownRNA interferenceEstrogen receptorBiologyEstrogen receptor alphaPhosphoinositide 3-kinaseP110αPI3K/AKT/mTOR pathwaySynthetic lethalityCell cultureSignal transductionCell biologyCancerBreast cancerMutantGeneBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Abstract #3063 Background: Endocrine therapy with estrogen deprivation (ED) induces cell cycle arrest in sensitive estrogen receptor positive (ER+) breast cancers, but typically not apoptosis, thus relapse is common despite ED due to residual surviving tumor cells. The phosphoinositide 3-kinase (PI3K) pathway, which promotes cell survival, is hyperactivated in ER+ breast cancer due to mutations of genes in the PI3K signaling cascade, most commonly PIK3CA. We therefore investigated the role of p110α and p110β, the gene products of PIK3CA and PIK3CB, in promoting cell survival in ER+ breast cancer. Materials and Methods: RNA interference (RNAi) was used to selectively inhibit p110α and p110β expression in the ER+, PIK3CA mutant MCF-7 and T47D cell lines; the ER+, PIK3CA wild-type but PIK3CB gene amplified HCC712 cell line; and the ER-, PIK3CA and PIK3CB wild-type MDA-MB-231 cell line. Western blotting was used to confirm p110α and p110β knockdown efficiencies and to determine the effects of specific knockdowns on PI3K pathway signaling. Cell line growth was measured using a resazurin reduction assay. Apoptosis was quantified using TUNEL/Hoechst staining. Gene copy number for PIK3CB was assessed by FISH in cell lines and tumor samples. Results: PIK3CA RNAi inhibited growth and activated apoptosis in all tested ER+ cell lines under ED, whereas the addition of estrogen reversed PIK3CA RNAi-induced apoptosis. PIK3CB RNAi inhibited proliferation and promoted apoptosis in the absence of estrogen only in the PIK3CB-gene amplified HCC712 cell line. In combination, PIK3CA and PIK3CB gene knockdowns produced a synergistic apoptotic effect on T47D and HCC712 cell lines, but not in MCF-7 cells which contain low levels of p110β protein. In contrast PIK3CA and PIK3CB RNAi did not promote apoptosis in the ER- MDA-MB-231 cell line. Finally, since PIK3CB gene amplification has not been described previously we conducted a screen by FISH and array CGH and detected low-level PIK3CB copy number gain or amplification in ∼5% of clinical samples from a series of breast cancer patients representing diverse clinical phenotypes (ER+, ER-, ERBB2+). Conclusions: Inhibition of the PI3K pathway through suppression of PI3K catalytic subunit expression produces a synthetic lethal effect in the absence of estrogen specifically in ER+ breast cancer cells. These data establish a preclinical rationale for combining endocrine therapy with PI3K pharmacological inhibitors in ER+ breast cancer, but suggest that both PIK3CA and PIK3CB are therapeutic targets and gene mutation or amplification in both catalytic subunits may have to be taken into account when identiying a sensitive population for PI3 kinase-directed therapy. Citation Information: Cancer Res 2009;69(2 Suppl):Abstract nr 3063.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,129
Tête enseignante GPT0,445
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
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