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Enregistrement W2318077359 · doi:10.1021/pr5001779

Proteasomal Serine Hydrolases Are Up-Regulated by and Required for Influenza Virus Infection

2014· article· en· W2318077359 sur OpenAlexafffund
M Shahiduzzaman, Peyman Ezatti, Gang Xin, Kevin M. Coombs

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésVirusProteasesInfluenza A virusBiologyMG132Viral replicationSerine proteaseVirologySerineImmune systemSerine hydrolaseSerine Proteinase InhibitorsProteaseEnzymeProteasomeCell biologyProteasome inhibitorBiochemistryImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interactions between viruses and their host cells are important determinants of virus replication and of immune responses to the virus. However, these interactions and resulting consequences of these interactions remain poorly defined. Numerous recent quantitative proteomic approaches have measured host proteins affected by virus infection. Here, we used activity-based protein profiling (ABPP) to measure functional alterations in host serine hydrolases after influenza A virus infection of Madin-Darby canine kidney and human A549 lung cells. We identified 62 serine proteases. We then combined the ABPP approach with stable isotope labeling to directly measure how serine hydrolase activities were affected by virus infection. Differentially regulated SHs mapped into a few key cellular pathway systems, most notably the proteasomal system. The specific serine protease inhibitors Aprotinin and Pefablock and specific proteasomal inhibitors Bortezomib and MG132 significantly inhibited influenza virus growth. Some inhibitors also down-regulated activities of several proteasomal proteins, including PSMA1, PSMA2, and PMSB3. Genetic knockdown of PMSA2 also attenuated influenza virus replication. These findings further our understanding of enzymatic cellular processes affected by influenza virus and may be beneficial in the search for additional antiviral therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,170
Score d'incertitude au seuil0,432

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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