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Enregistrement W2318100480 · doi:10.1093/neuonc/nov061.134

PM-12 * USING A ZEBRAFISH PEDIATRIC BRAIN TUMOR MODEL FOR PRE-CLINICAL DRUG SCREENING

2015· article· en· W2318100480 sur OpenAlexaff
K. Modzelewska, Daniel Picard, Esther de Boer, Rodney R. Miles, Randy L. Jensen, Theodore J. Pysher, Joshua D. Schiffman, Cicely A. Jette, Annie Huang, Rodney A. Stewart

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishDrugMedicineComputational biologyOncologyPharmacologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Modeling cancer in zebrafish is a rapidly growing area of research due to unique imaging and drug screening attributes of the system, as well as cost. While over 20 different zebrafish cancer models have been established, no genetically engineered models of pediatric brain tumors exist. We are using genomic editing techniques with traditional transgenic approaches to model pediatric brain tumors in zebrafish for gene discovery and drug screening. As Primitive Neuroectodermal Tumors (PNETs) represent the largest group of malignant brain tumors in children, we used sequencing and genomics data to predict oncogenic drivers of different PNET subtypes and generated the first zebrafish PNET model. Specifically, we show that activation of NRAS signaling in embryonic oligodendrocyte precursor cells with p53-deficiency generate oligoneural PNETs along the entire CNS axis, with conserved histological and molecular features to human medulloblastoma and CNS-PNETs, including activated SHH signaling and loss of RB signaling. We have also developed new embryonic brain tumor transplantation assays for high-throughput drug screening on hundreds of animals/day and show MEK activity is essential for the oligoneural CNS-PNET tumor growth in vivo. Thus, MEK inhibitors may represent the first targeted therapy option for children with oligoneural CNS-PNETs. We will present these results and plans for expanding the zebrafish system to generate other classes of brain tumors and for growing human PDX's in zebrafish.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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