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Enregistrement W2318253638 · doi:10.1016/j.clpt.2005.12.033

PI-12Amantadine acetylation as a biomarker for malignancy

2006· article· en· W2318253638 sur OpenAlexaff
Daniel Sitar, Alexandra Le Bras, A Maksymiuk, A PABBIES, L. J. Brandes, Brette Blakely

Notice bibliographique

RevueClinical Pharmacology & Therapeutics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSputumMedicineInternal medicineGastroenterologyUrineBiomarkerCancerBladder cancerAmantadineLung cancerMalignancyPharmacologyPathologyTuberculosisBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND Since amantadine acetylation occurs only by spermine-spermidine acetyltransferase, and the enzyme is induced in tumor tissue, we hypothesized that amantadine acetylation would serve as a biomarker for malignancy. METHODS We conducted a phase 2 clinical trial to test the hypothesis. We recruited 109 patient volunteers diagnosed with cancer, and at various stages of treatment, who presented to our outpatient clinics. Age ranged from 30–83 yr (median 62 yr) and the majority were male 64M:45F. One hundred patients completed the protocol. Two hr after supper, patients ingested 200 mg of amantadine HCl and urine was collected for the next 12 hr. Seven patients with head and neck cancer also provided a sputum sample 2 hr after amantadine ingestion. Blinded samples were analyzed for amantadine and its acetyl metabolite. RESULTS All specimens contained amantadine, and 9 urine samples contained acetylamantadine, as did 2 sputum samples. Positive sputum samples were not concordant with respective urine samples. Diagnoses for patients positive for acetylamantadine included lung cancer, 4/43, head and neck cancer, 4/12, multiple myeloma, 1/1, pancreatic cancer, 1/2, and a neuroendocrine tumor, 1/1. CONCLUSIONS Initial findings support our hypothesis. Positive sputum samples suggest that timing of specimen collections may be critical, and that sputum may represent a more convenient biological specimen to investigate this metabolic association more critically. Clinical Pharmacology & Therapeutics (2005) 79, P10–P10; doi: 10.1016/j.clpt.2005.12.033

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,351 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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