Glutathione <i>S</i>-Transferase (GST) M1, but Not GSTT1, Genotype Influences Plasma Proteomic Profiles in Caucasian and East Asian Young Adults
Notice bibliographique
Résumé
Glutathione S-transferase (GST) M1 and T1 are major detoxifying enzymes that have been associated with a number of chronic diseases, but their effect on various physiological pathways remains unclear. We investigated the association between the common GSTM1 and GSTT1 genotypes and multiple disease-related high-abundance proteins of the plasma proteome in young Caucasian (n = 476) and East Asian (n = 352) adults. Overnight fasting blood samples were collected, and 54 high-abundance plasma proteins from several physiological pathways were quantified by mass spectrometry-based multiple reaction monitoring (LC-MRM/MS). Subjects were genotyped for GSTM1 and GSTT1 deletion polymorphisms. Principal component analysis was used to identify proteomic profiles, and differences in individual protein concentrations between genotypes were assessed by ANCOVA. Among Caucasians, 19 proteins differed between GSTM1 genotypes (P < 0.05), with all protein concentrations being higher among the null genotypes. However, only complement C3 reached the Bonferroni-corrected significance threshold for multiple testing (P < 0.0009). Among East Asians, three proteins differed between GSTM1 genotypes (P < 0.05) with higher concentrations among the null genotypes, but none reached the Bonferroni level of significance. Protein concentrations did not differ between GSTT1 genotypes in either ethnicity. These findings suggest that GSTM1 may have novel physiological effects related to immunity and cardiometabolic disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».