Abstract 1052: RNAi-mediated mutual regulation of FGF-2 and its antisense gene, NUDT6, in C6 glioma cells.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Basic fibroblast growth factor (FGF-2) is a potent wide-spectrum antiapoptotic mitogen, and the dysregulation of its expression is associated with cell proliferation and immortalization in a wide variety of tumors. We have previously reported that FGF-2 and NUDT6, the product of its antisense gene, are co-localized and inversely expressed in C6 glioma cells, and that constitutive overexpression of NUDT6 suppresses cellular FGF-2 expression, nuclear translocation, and the resumption of cell cycles (Baguma-Nibasheka et al., Mol Cell Endocrinol, 267:127-136, 2007). For the current report, we investigated the role of the endogenous RNAi machinery in mediating the post-transcriptional effects of NUDT6 on FGF-2 expression. FGF-2 knockdown was accompanied by a significant (>3 fold) increase in NUDT6 mRNA, and vice versa. Similar converse effects were observed on the cognate protein levels, as assessed by confocal immunoflourescence, Western blotting, and flow cytometry, indicating that these two transcripts may be mutually regulatory. Remarkably, knockdown of either transcript reduced cell proliferation and inhibited S-phase re-entry following serum deprivation (Table 1), indicating that both FGF-2 and NUDT6 may be involved in the regulation of cell cycle progression. Supported by the CIHR and NSERC.Table 1.S-Phase Percentages1 of C6 Cells following Knockdown and G0 Arrest.Hours after Return to 10% FBS Medium0361224Control siRNA4.8 ± 0.516.8 ± 1.321.6 ± 1.822.4 ± 1.123.0 ± 1.5NUDT6 siRNA4.1 ± 0.510.6 ± 1.3*14.2 ± 1.6*16.7 ± 1.8*19.8 ± 0.8FGF-2 siRNA3.5 ± 0.55.9 ± 0.8*6.9 ± 1.2*11.2 ± 1.1*14.5 ± 1.0*1mean ± SEM. * = significantly different from control; p<0.05, n=3. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 1052.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».