Abstract 2550: Expanded simple tandem repeat (ESTR) mutations in offspring of benzo(a)pyrene exposed DNA repair deficient male mice
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Germ line mutations can be transmitted to the offspring and may thus affect an infinite number of generations thereafter. To study germ line mutations, expanded simple tandem repeats (ESTR) can be used as a sensitive tool, because they are known to be highly unstable and therefore exhibit high mutation rates. This facilitates the assessment of germ line mutations in a relatively small number of offspring following exposures that may pose a genetic risk to the germ line. We used two ESTR loci Ms6-hm and Hm-2 in families of benzo(a)pyrene (BaP) exposed and unexposed male mice, proficient or deficient for global genome repair (Xpc-/-). Male mice (C57BL/6) were exposed to BaP during 6 weeks (13 mg/kg bw, 3 times per week) and were crossed with female mice (Balb/C) 6 weeks after the last exposure to obtain offspring and to ensure the analysis of mutations originating from spermatogonial stem cells. The overall ESTR mutation rate at both ESTR loci, irrespective of the DNA repair capacity, was higher in offspring of benzo(a)pyrene exposed mice than in control mice (9.4% vs. 4.5%, P=0.054). This effect was predominantly seen in BaP exposed DNA repair deficient Xpc-/- mice; mutation frequencies were 12.5% in the exposed group (12 out of 96 offspring carried a mutant allele) and 3.4% in the unexposed group (3 out of 87), respectively (P=0.024). In DNA repair proficient mice, BaP was unable to increase the mutation frequency transmitted to the offspring (5.8% vs. 5.5% for offspring of exposed and unexposed fathers). These results indicate that analysis of tandem repetitive sequences is a sensitive method for the detection of germline mutations transmitted to the offspring and that the environmental mutagen BaP is able to induce germ line mutations in DNA repair deficient mice. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 2550. doi:1538-7445.AM2012-2550
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».