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Enregistrement W2318945865 · doi:10.2174/092986711796391714

Managing the Liabilities Arising from Structural Alerts: A Safe Philosophy for Medicinal Chemists

2011· review· en· W2318945865 sur OpenAlex
Paul Edwards, Claudio F. Sturino

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCurrent Medicinal Chemistry · 2011
Typereview
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensBoehringer Ingelheim (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReactive intermediateElectrophileChemistryCovalent bondDrug reactionMechanism (biology)Adverse Outcome PathwayMacromoleculeCovalent bindingXenobioticDrugComputational biologyBiochemistryCombinatorial chemistryPharmacologyEnzymeBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bioactivation of xenobiotics can, in certain circumstances, result in the formation of reactive electrophilic species. These reactive metabolites may covalently modify proteins and macromolecules and it has been suggested that protein modification is a key initial step in provoking idiosyncratic adverse drug reactions. Understanding these bioactivation pathways is critical in order to rationally design drug candidates with a lower propensity to form reactive intermediates. Herein, we provide an overview of the importance of Structural Alerts and bioactivation pathways and describe the creation of an in-house database as a tool aimed at informing medicinal chemists about these potential liabilities. Keywords: Structural alerts, bioactivation, hepatotoxicity, mechanism based CYP inactivation, metabolic switching, covalent protein modification, reactive intermediates, xenobiotics, reactive electrophilic species, macromolecules

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,979
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,117
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle