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Enregistrement W2319473164 · doi:10.1139/o11-061

<i>Schizosaccharomyces pombe</i>, unlike <i>Saccharomyces cerevisiae</i>, may not directly regulate nuclear-cytoplasmic transport of spliced tRNAs in response to nutrient availability

2011· article· en· W2319473164 sur OpenAlexafffundvenue
Jacqueline B. Pierce, Dev Mangroo

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSaccharomyces cerevisiaeSchizosaccharomyces pombeBiologyRibosome biogenesisNuclear transportCell biologyNuclear export signalNutrient sensingBiogenesisKluyveromyces lactisSchizosaccharomycesBiochemistryCytoplasmYeastRNAGeneCell nucleusRibosomeSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eukaryotic cells adapt to changes in nutrient levels by regulating key processes, such as gene transcription, ribosome biogenesis, and protein translation. Several studies have shown that nuclear export of tRNAs is also regulated in Saccharomyces cerevisiae and rat hepatoma H4IIE cells during nutrient stress. However, recent studies suggest that nutrient stress does not affect nuclear tRNA export in several mammalian cell lines, including rat hepatoma H4IIE. Furthermore, in contrast to previous studies, data reported more recently established that nuclear export of mature tRNAs derived from intron-containing pre-tRNAs, but not mature tRNAs made from intronless precursors, is affected by nutrient stress in several species of Saccharomyces, but not in the yeast Kluyveromyces lactis . Here, we provide evidence suggesting that Schizosaccharomyces pombe, like mammalian cells and K. lactis, but unlike Saccharomyces, do not directly regulate nuclear export of mature tRNAs made from intron-containing pre-tRNAs in response to nutrient stress. These studies collectively suggest that regulation of nuclear export of spliced tRNAs to the cytoplasm in response to nutrient availability may be limited to the genus Saccharomyces, which unlike other yeasts and higher eukaryotes produce energy for fermentative growth using respiration-independent pathways by downregulating the citric acid cycle and the electron transport chain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2011
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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