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Enregistrement W2319496810 · doi:10.12705/631.1

Phylogeny of the restiid clade (Poales) and implications for the classification of Anarthriaceae, Centrolepidaceae and Australian Restionaceae

2014· article· en· W2319496810 sur OpenAlexaff
Barbara G. Briggs, Adam Marchant, Andrew J. Perkins

Notice bibliographique

RevueTaxon · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Species Descriptions
Établissements canadiensDepartment of Environment and Conservation
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSynapomorphyCladeMonophylyBiologySubfamilySister groupEvolutionary biologyZoologyBotanyPhylogeneticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Three families, Anarthriaceae, Restionaceae and Centrolepidaceae, are generally recognised in the restiid clade of Poales. A new phylogeny is presented, with fuller sampling of Australian taxa, based on analyses of trnL‐F , trnK and rbcL data from the chloroplast genome. The findings agree with the major groups shown in previous molecular studies but provide a more substantial basis for reviewing the classification at family and generic levels. Anarthriaceae is sister to Restionaceae, with Anarthria sister to Lyginia + Hopkinsia . Centrolepidaceae, on an extremely long branch, appears embedded in Restionaceae in Bayesian trees; although it appears as sister to Restionaceae in analyses that are more subject to long‐branch attraction (in parsimony analyses and those of data from the less‐conserved trnL‐F cpDNA region). Accepting the embedded position, which would make this a subfamily of Restionaceae, the basal division in the Restionaceae separates the African subfamily Restionoideae from the Australasian clade (Sporadanthoideae, Centrolepidoideae, Leptocarpoideae). In subfamily Leptocarpoideae, Eurychorda forms the basal branch. At the next dichotomy the Leptocarpus clade, together with the Winifredia clade, is separated from a diverse assemblage including Loxocarya , Chordifex , Baloskion , Desmocladus , Lepidobolus and allied genera. The phylogeny indicates that several currently recognised genera are not monophyletic and that changes to the generic classification are required. A matrix of morphological characters was prepared and these were mapped onto the Bayesian consensus DNA tree to identify synapomorphies of the clades and genera. Observations on leaf laminae indicate that fully or partially unifacial leaf laminae are a synapomorphy of the restiid clade. The morphological characterisation of the following are considered: the restiid clade, Anarthriaceae, Restionaceae enlarged to include subfamily Centrolepidoideae, Leptocarpus s.l. (including as potential synonyms Meeboldina and Stenotalis ) and Desmocladus s.l. (including potentially Harperia , Onychosepalum and Kulinia ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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