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Enregistrement W2319532613 · doi:10.1097/ypg.0b013e32834133bc

Methylation analysis of the NOTCH4 -25 C/T polymorphism in schizophrenia

2010· article· en· W2319532613 sur OpenAlex
Patrick P. McDonald, Richard O’Reilly, Shiva M. Singh

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePsychiatric Genetics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMethylationDNA methylationBiologyGeneticsPolymorphism (computer science)Human braingenomic DNAGeneAlleleMolecular biologyGene expressionNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The major histocompatability complex on chromosome 6p has often been identified as containing potential risk factors for schizophrenia. The NOTCH4 gene is located within this region (6p21.3) and sequence variants have previously shown association to the disease. It is further implicated from a functional standpoint as it plays a critical role during the neurodevelopmental process. METHODS: This research examined the methylation status of a region surrounding the NOTCH4 -25 C/T site in leukocyte genomic DNA and human brain regions. It also examined the polymorphism status of NOTCH4 -25 C/T. The sample included 40 individuals (16 affected, 24 controls) and 31 regions of an adult human brain (from a single individual). RESULTS: This study established that the -25 C was the only cytosine which showed methylation in any of the blood or brain samples analyzed. Furthermore, -25 C (i) was always fully or partially methylated in blood (ii) was methylated in a similar pattern between the affected and controls in the blood (iii) was variably methylated in the brain, including completely methylated, partially methylated, subtly methylated or not methylated. It also established that the -25 C/T polymorphism was not associated to schizophrenia. CONCLUSION: The polymorphism and methylation analysis of NOTCH4 established that (i) the -25 C/T polymorphism and methylation status is not associated to schizophrenia in blood (ii) the -25 C is variably methylated in a region specific manner in the brain (iii) there is more variability observed within the brain of a single individual than in the blood among the individuals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,537
Score d'incertitude au seuil0,445

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle