MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2320142960 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-2396

Abstract 2396: Function of HLTF in the development of colon cancer and in the maintenance of genomic stability

2011· article· en· W2320142960 sur OpenAlexaff
Sumit Sandhu, Xiaoli Wu, Sabine Mai, Hao Ding

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCarcinogenesisKnockout mouseGenome instabilityBiologyTranscription factorCancer researchCell biologyChemistryGeneticsDNA damageCancerGeneDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract HLTF (Helicase like Transcription Factor) is a DNA helicase protein which is homologous to SNF/SWI family. It has also been shown to be a functional homolog of yeast rad5, required for the maintenance of genomic stability through the ubiquitination of proliferating cell nuclear antigen (PCNA). Although the physiologic role of HLTF is largely unknown, inactivation of HLTF by promoter methylation has been demonstrated in more than 40% human colon cancers. In this study, we have applied mouse transgenic approaches to determine whether loss of HLTF function could be important for colorectal carcinogenesis. HLTF knockout mice were created by the deletion of first 5 exons of HLTF genome. The complete loss of HLTF expression in these mice was confirmed by Northern blot and RT-PCR assays. HLTF knockout mice did not show any developmental defects within a 2-year observation, indicating that HLTF is dispensable for normal development, and loss of HLTF function alone is not sufficient to drive colon carcinogenesis. To determine whether loss of HLTF function could cooperate with other tumor suppressors in the formation of colon cancers, we have bred HLTF knockout mice with the mutant mice for p53 and Apc (adenomtous polyposis coli). In HLTF−/−/Apc+/− mice, the significantly increased formation of intestinal adenocarcinoma and colon cancers were observed. Although very few HLTF−/−/p53−/− mice developed colon cancers, these mice had increased incidence of lymphoma formation. This finding suggests that loss of HLTF function could not only promote colon cancer formation, but also for other types of tumor. Cytogenetic analysis of colon cancer cells derived from HLTF−/−Apc+/− mice demonstrated a high incidence of gross chromosomal instabilities, including Robertsonian fusions, fragments and aneuploidy. All these genetic alterations were not observed in the intestinal tumor cells from Apc+/−, implicating that loss of HLTF function could induce genomic instability which contributes to colorectal carcinogenesis. To further establish the role of HLTF in the maintenance of genomic stability, we have also derived HLTF deficient mouse embryonic stem (ES) cells, and demonstrated that HLTF−/− ES cells exhibited similar, but a milder genetic alterations as observed in HLTF deficient colon cancer cells. Taken together, our work provides direct genetic evidence that loss of HLTF function as observed in a majority of human colon cancers is able to promote colorectal carcinogenesis. This function could be mediated by the induced genomic instability. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 2396. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-2396

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Research→Même sujetEpigenetics and DNA Methylation→Travaux en français237 207→