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Enregistrement W2320321573 · doi:10.1021/jp2049525

Antioxidant Potential of Glutathione: A Theoretical Study

2011· article· en· W2320321573 sur OpenAlexaff
Béla Fiser, Milán Szöri, Balázs Jójárt, Róbert Izsák, Imre G. Csizmadia, Béla Viskolcz

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueFree Radicals and Antioxidants
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésChemistryBond-dissociation energyPolarizable continuum modelDissociation (chemistry)PolarizabilityComputational chemistryDensity functional theoryHydrogen bondPhysical chemistrySolvent effectsSolventMoleculeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

All possible X-H (where X can be C, N, O or S) bond dissociation energies (BDEs) of glutathione (γ-L-glutamyl-L-cysteinyl-glycine, GSH) and its fragments have been calculated by first principle methods, and the antioxidant potential of GSH was revealed to be higher than expected in earlier studies. Electron delocalization was found to have an important influence on the antioxidant potential. All structures were optimized and their harmonic vibrational frequencies were calculated in the gas phase at the B3LYP/6-31G(d) level of theory. Solvent effects were taken into account for optimizations at the same level of theory by applying the conductor-like polarizable continuum model (CPCM). Hydrogen cleavage from glutathione proved that the G3MP2B3 composite method provides results consistent with the experimental values for bond dissociation enthalpies (DH(298)) of S-H, O-H, C-H, and N-H bonds. In order to replace the G3MP2B3 energies with accurate single point calculations, six density functionals, namely, MPWKCIS, MPWKCIS1K, M06, TPSS1KCIS, TPSSh, and B3LYP, were tested against G3MP2B3 for obtaining accurate bond dissociation energies. The MPWKCIS1K/6-311++G(3df,2p)//B3LYP/6-31G(d) level of theory provides the best correlation with the G3MP2B3 method for BDEs in both phases, and therefore, it is recommended for similar calculations. Gas phase results showed that the O-H bond was the weakest, while in aqueous phase the N-H bond in the ammonium group proved to have the smallest BDE value in the studied system. In both cases, the cleavage of the X-H bond was followed by decarboxylation which was responsible for the energetic preference of these processes over the S-H dissociation, which was regarded as the most favorable one until now. The calculated BDE values showed that in aqueous phase the most preferred H-abstraction site is at the weakest N-H bond (BDE(aq) = 349.3 kJ mol(-1)) in the glutamine fragment near the α-carbon. In water, the formation of N-centered radicals compared to S-centered ones (BDE(aq) = 351.7 kJ mol(-1)) is more endothermic by 2.54 kJ mol(-1), due to decarboxylation. Hydrogen dissociation energies from the α-carbons are also comparable in energy with those of the thiol hydrogen, within computational error. The higher stability of the radicals--except the S-centered ones--is due to various degrees of electron delocalization. In aqueous phase, four quasi-equivalent stable radical centers (the α-carbons, the N-centered radical of the NH(2) group, and the S-centered radical) were found which provide the antioxidant behavior of glutathione.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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