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Enregistrement W2320408102 · doi:10.1021/jp209344z

Modeling the Behavior of Coarse-Grained Polymer Chains in Charged Water Droplets: Implications for the Mechanism of Electrospray Ionization

2011· article· en· W2320408102 sur OpenAlexafffund
Elias Ahadi, Lars Konermann

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésChemical physicsPolymerChemistryMolecular dynamicsMacromoleculeSolvationElectrospray ionizationSide chainElectrosprayAqueous solutionIonComputational chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mechanism whereby macromolecular analytes are transferred into the gas phase during the final stages of electrospray ionization (ESI) remains a matter of debate. In this work, we employ molecular dynamics simulations to examine the temporal behavior of nanometer-sized aqueous ESI droplets containing a polymer chain and excess ammonium ions. The polymer is modeled using a coarse-grained framework where a bead-string backbone is decorated with side chains that can be nonpolar, cationic, or anionic. Polymers that adopt compact conformations and that carry a large number of charged side chains remain close to the droplet center, where the charges are extensively hydrated. The ESI process for these compact/hydrophilic macromolecules must involve solvent evaporation to dryness. This behavior is consistent with the charged residue model (CRM). A completely different scenario is encountered for disordered (extended) chains that carry a large number of nonpolar side chains. In this case, the macromolecule tends to be rapidly expelled from the droplet surface in a stepwise sequential fashion. This process produces metastable structures where one end of the extended polymer chain remains connected with the droplet via charge solvation. Disruption of these last interactions will then produce a free gas phase macromolecular ion. The data of this work imply that the ESI process for unfolded/hydrophobic polymers proceeds via an ion evaporation (IEM)-like mechanism that is facilitated by hydrophobic solute/solvent interactions. Our model predicts that the ESI efficiency of the latter scenario is considerably higher than for the CRM. This prediction is verified experimentally through ESI mass spectrometry measurements on myoglobin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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