Abstract 2244: The M-SKIP Project: an international pooled-analysis on melanocortin-1 receptor (MC1 R) variants and skin carcinogenesis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: MC1R is one of the major genes involved in the determinism of skin pigmentation. The role of MC1R variants in skin carcinogenesis was previously investigated by a meta-analysis of 18 published studies. Although the results were informative, published data were not enough to deeply investigate the specific contribution of each MC1R variant on skin cancer development. Aim: The M-SKIP Project aims to perform an international collaborative pooled-analysis on the role of MC1R variants in skin carcinogenesis, using individual patient data. The main endpoint is skin cancer. Secondary endpoints are phenotypic characteristics involved in skin carcinogenesis, e.g. freckling. Methods and Patients: An Advisory Committee of investigators with great expertise in melanoma and genetic research was established. The authors of appropriate papers were invited to provide their original published and unpublished data. Preliminary results: Up to February 2010, 27 out of 35 contacted investigators (77%) agreed to join the M-SKIP Project. Thanks to the positive response obtained up to now, we estimate to receive data on around 6,500 melanoma cases, 1,500 non-melanoma skin cancer cases and 13,000 controls. So far, we have already received data on 2,683 melanoma cases, 1,364 non-melanoma skin cancer cases and 4,340 controls from 15 investigators internationally. After quality controls, data are inserted in a central database, and pooled-analysis will be performed in order to evaluate: (1) the association between MC1R variants and skin cancer overall, and by skin cancer type; (2) the association between MC1R variants and phenotypic characteristics under study; (3) MC1R-phenotype interaction in skin cancer risk. In addition, stratified analysis will be performed to understand the independent and dependent role of MC1R variants in skin cancer development by phenotypic characteristics. Conclusion: The pooled analysis approach applied in such a setting is particularly useful because it will help reaching firm conclusions even in sub-group and interaction analyses, controlling for important confounders. This data-bank will represent a reference and guide for all investigators working in this research field. Collaboration within investigators would significantly improve the knowledge and accelerate our understanding of the role of MC1R variants in skin carcinogenesis. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 2244. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-2244
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,048 | 0,071 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,005 | 0,015 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».