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Enregistrement W2320569320 · doi:10.3899/jrheum.131381

Genetic Polymorphisms of <i>Foxp3</i> in Patients with Rheumatoid Arthritis

2014· article· en· W2320569320 sur OpenAlexvenueno aff
Agnieszka Paradowska‐Gorycka, Monika Jurkowska, Anna Felis‐Giemza, Katarzyna Romanowska‐Próchnicka, Małgorzata Mańczak, Sławomir Maśliński, Marzena Olesińska

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRheumatoid Arthritis Research and Therapies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFOXP3HaplotypeRheumatoid arthritisImmunologyLinkage disequilibriumMedicineGenotypeAlleleAutoimmunityGeneticsAutoimmune diseaseArthritisPathogenesisPopulationInternal medicineImmune systemBiologyGeneAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: The aim of the study was to identify 2 polymorphic variants in the promoter region of the Foxp3 gene and their possible association with susceptibility to and severity of rheumatoid arthritis (RA). The association between genetic factors and pathogenesis suggests that T cells take part in the induction of RA. The CD4+CD25highFoxp3+ subset of regulatory T cells plays an essential role in preventing autoimmunity and maintaining immune homeostasis. METHODS: Patients with RA (n = 274) and healthy individuals (n = 295) were examined for -3279 C/A and -924 A/G Foxp3 gene polymorphisms by the polymerase chain reaction-restriction fragment-length polymorphism method. Serum Foxp3 levels in patients with RA and controls were measured with ELISA. RESULTS: Foxp3 -3279 A and -924 G alleles were associated with significantly elevated risk of RA in the population tested (p = 0.003 and p = 0.004, respectively) compared to the wild-type alleles. Overall, -3279 C/A and -924 A/G Foxp3 gene polymorphisms were in indistinct linkage disequilibrium with D' = 0.481 and r(2) = 0.225. From 4 possible haplotypes, frequencies of 2 (AG and CA) showed significant differences between both examined groups (respectively, p < 0.001 and p = 0.007). After appropriate adjustment of Bonferroni correction for multiple testing, the genotype-phenotype analysis showed no significant correlation of the Foxp3 -3279 C/A and -924 A/G polymorphisms with the disease activity, joint damage, laboratory variables, and extraarticular manifestation in patients with RA. Serum Foxp3 level was significantly higher in patients than in controls (p < 0.0001). CONCLUSION: Current findings indicated that the Foxp3 genetic polymorphism and the Foxp3 protein level may be associated with susceptibility to RA in the Polish population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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