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Enregistrement W2320576724 · doi:10.1021/pr200345y

Proteomic Analyses of Lung Lysates from Short-Term Exposure of Fischer 344 Rats to Cigarette Smoke

2011· article· en· W2320576724 sur OpenAlexaff
Charleata A. Carter, Manoj Misra, Steven Pelech

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSmoking Behavior and Cessation
Établissements canadiensKinexus Bioinformatics Corporation (Canada)University of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCigarette smokeLungSmokeChemistrySidestream smokeChromatographyToxicologyMedicineBiologyInternal medicineOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A short-term 5 day mainstream cigarette smoke exposure study was conducted in Fischer 344 rats to identify changes in lung proteins. Groups of 10 male and female rats at 5 weeks of age were assigned to one of four exposure groups. Animals received either nose-only filtered air (Air Control) or 75, 200, or 400 mg total particulate matter (TPM)/m(3) of diluted cigarette smoke. Exposures were conducted for 3 h per day, for 5 consecutive days. One lung per animal was frozen in liquid nitrogen and processed for proteomic analyses. Lung lysates from control verses treated animals were screened with 650 antibodies for changes in signaling protein levels and phosphorylation using antibody microarray technology, and then over 100 of the top protein hits were assessed by immunoblotting. The top smoke-altered proteins were further evaluated using reverse lysate microarrays. Major protein changes showed medium to strong bands on Western blots, depended on dose and gender, and included protein-serine kinases (Cot/Tpl2, ERK1/2, GSK3α/β, MEK6, PKCα/γ, RSK1), protein phosphatases (PP4/A'2, PP1Cβ), and other proteins (caspase 5, CRMP2, Hsc70, Hsp60, Rac1 and STAT2). The most pronounced changes occurred with 75 mg TPM/m(3) exposed females and 200 mg TPM/m(3) exposed males. Smoke-altered proteins regulate apoptosis, stress response, cell structure, and inflammation. Changes in identified proteins may serve as early indicators of lung damage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,812

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,285
Tête enseignante GPT0,458
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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