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Enregistrement W2320739989 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-5351

Abstract 5351: Prevalence and function of p53 mutations among children with adrenocortical carcinoma (ADCC)

2011· article· en· W2320739989 sur OpenAlexaff
Jonathan D. Wasserman, Ana Novokmet, Claudia Eichler-Jonsson, David Malkin

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationAdrenocortical carcinomaGermlineGermline mutationGeneticsMutationBiologyPedigree chartCancer researchMedicineGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Adrenocortical carcinoma (ACC) is a rare tumor in children, affecting 0.4 per million children worldwide. Incidence in adults is approximately 5-fold higher and may represent a distinct genetic and biologic entity. Mortality rates among patients with ACC are high and treatment options are limited. Previous studies have suggested that a majority of children who develop ACC possess germline mutations in the p53 tumor suppressor gene. In this study we sought to characterize the prevalence and mutational spectrum of p53 among a large multi-center cohort of children with ACC. We further compared the specific mutations found in these children with mutations found in individuals with the Li-Fraumeni syndrome, a familial cancer predisposition syndrome which is strongly associated with germline p53 mutation. Among 58 independent pedigrees assessed for p53 mutation, 29 (50%) carried a heterozygous mutation in p53. No mutation was identified more than once among this cohort. This is in contrast to families with the LFS, where 6 “hotspot” mutations are disproportionately over-represented, combined accounting for 20% of patients with identified p53 mutations. Missense mutations were noted in 28/29 individuals, with a single intragenic deletion identified in the remaining individual. Mutations were found predominantly within the DNA-binding domain (26/29 (90%)). One mutation was identified in the trans-activation domain and two in the oligomerization domain. In the course of this analysis, we identified several novel p53 mutations among children with ACC. These mutations were functionally characterized in vitro based on the ability of mutant p53 to activate transcription of known p53 target genes including those involved in DNA damage repair, cell-cycle arrest and apoptosis. Dominant-negative activity of these mutations was also assessed. Several of the novel mutations demonstrated either full p53 function or partial loss-of-function. The association of these seemingly milder mutations with adrenal tumorigenesis suggests that adrenal tissues may be more sensitive to partial decrease in p53 function than other LFS-affected tissues and that other predisposing or disease-modifying genetic alterations may exist to propel these cells towards a transformed fate. Further efforts to identify disease modifying loci, as well as pathogenic loci in children with wild-type p53 genes are underway via genome-wide analysis. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 5351. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-5351

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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