Prospective prediction of germ line mutations in patients with pheochromocytomas and paragangliomas according to biochemical profiles
Notice bibliographique
Résumé
Background: Over 30% of pheochromocytomas and paragangliomas (PPGLs) are hereditary, and at least 16 tumor susceptibility genes have been identified to date. Measurements of plasma O-methylated metabolites may be useful predictive markers of underlying germ line mutations among PPGLs patients, but this has not been validated in any prospective study. Methods: Underlying mutations were predicted according to plasma concentrations of O-methylated metabolites measured by liquid chromatography tandem mass spectrometry in 159 patients with PPGLs at 6 European centers. Predictions were compared with results of mutation testing. Results: Patients included 68 with tumors characterized by epinephrine production, among whom 65 were predicted for RET , NF1 or TMEM 127 mutations, 2 for MAX , and 1 for VHL / SDH or MAX mutations. For 91 patients, disease was without tumoral epinephrine production, among whom 1 was predicted for MAX and 87 for VHL or SDHx gene mutations. The latter included 29 patients with elevated methoxytyramine (MTY) in who SDHx mutations only were predicted. Among all patients, there were 53 determined to have underlying mutations of tumor susceptibility genes (13 SDHB , 1 SDHC , 16 SDHD , 8 VHL , 5 NF1 and 10 RET ). Among these 53 patients, the pattern of biochemical results correctly predicted the underlying mutations in all but in one case. Fourteen patients were correctly identified to have RET or NF1 mutations according to elevations in plasma metanephrine (MN) levels, whereas 1 patient with a RET mutation was incorrectly predicted for either a VHL , SDHx or MAX mutation according to an elevation in both MN and normetanephrine. All 38 patients with VHL/SDHx mutations were correctly identified according to lack of elevation in plasma MN, including 17 patients who were correctly identified for SDHx mutations based on elevated plasma MTY levels. Conclusions: This prospective study establishes that among patients with mutations of tumor susceptibility genes, plasma catecholamine O-methylated metabolites can predict the nature of the underlying mutations with 98% accuracy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».