MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2320777188 · doi:10.1097/00004872-200202000-00010

Identification and chromosomal localization of ecogenetic components of electrolyte excretion

2002· article· en· W2320777188 sur OpenAlexaff
Pierre Dumas, Vladimı́r Křen, D Křenová, Michal Pravenec, Pavel Hamet, Johanne Tremblay

Notice bibliographique

RevueJournal of Hypertension · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenin-Angiotensin System Studies
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExcretionHeritabilityEndocrinologyInternal medicineLocus (genetics)Quantitative trait locusMedicineGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To determine to what extent urinary excretion of blood pressure-modulating electrolytes is genetically determined, and to identify their chromosomal localization. DESIGN AND METHODS: Twenty-six rat recombinant inbred strains (RIS) originating from reciprocal crosses of normotensive Brown Norway (BN.Lx) and spontaneously hypertensive rats (SHR) were used. A pilot experiment on a subset of strains determined that fasting decreases the impact of environmental noise and increases that of heritability. Twenty-four-hour urinary collections were obtained from fasting rats aged 6-12 weeks (3-8 rats per strain). Sodium (Na), potassium (K) and calcium (Ca) excretions were measured, and the Na/K ratio calculated. These phenotypes served as quantitative traits for the search of quantitative trait loci (QTLs) by scanning the RIS genome that was mapped with 475 polymorphic markers. RESULTS: Constant Na intake resulted in a low heritability for Na excretion, reflecting the environmental impact (intake = excretion), whereas fasting revealed a gradient among RIS indicative of the genetic component of the traits. In the fasting state, a locus on chromosome 14 was found to be significantly associated with K excretion (Alb, P = 0.00002, r = -0.69, logarithm of the odds score (LOD) 3.9), whereas another locus on chromosome 10 (D10Cebrp97s5, P = 0.0003, r = -0.69, LOD 3.0) and one on chromosome 6 (D6Cebrp97s14, P = 0.0007, r = -0.65, LOD 1.9) were more significantly associated with Na excretion and the Na/K ratio respectively. The observed correlations were all negative for Na, K and Na/K, indicating a higher excretion of Na and K and a greater Na/K ratio in rats bearing BN.Lx alleles at these loci, i.e. salt retention in fasting SHR. These three loci accounted for 47-55% of variance of their associated trait, suggesting that they are the main genetic determinants for these phenotypes in basal fasting conditions. Rats bearing the Y chromosome of SHR origin had significantly higher K excretion that, in turn, led to a significantly lower Na/K ratio. Finally, a locus on chromosome 7 was linked to Ca excretion, explaining 46% of the trait variance (D7Mit10, LOD score 3.0). CONCLUSION: RIS enabled us to determine QTLs for environmentally modulated traits such as Na, K and Ca excretions. We demonstrated that whereas urinary electrolytes are determined mainly by intake (environment) in a steady state, their excretion in an adaptive state (fasting) is predominantly genetically determined by distinct QTL on autosomes as well as the Y chromosome. Furthermore, the loci responsible for Na and K excretions act independently of the locus governing the relative excretion of Na/K. Thus, the salt-retaining aspects of some hypertensives may be, in large part, determined by genes responsible for renal excretion, the impact of which is predominant over the environment under acute challenge.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,712
Score d'incertitude au seuil0,261

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of HypertensionMême sujetRenin-Angiotensin System StudiesTravaux en français237 207