Immunomodulatory factors and infectious agents associated with the hepatic gene expression of the IGF system in nursery pigs
Notice bibliographique
Résumé
Recent findings suggest there is a complex interaction between the IGF system and the inflammatory immune response. The objective of this study was to determine whether gene expression of growth factors (IGF-1, IGF-binding protein-3 (IGFBP-3) and growth hormone receptors (GHR)) in the liver is associated with gene expression of immunomodulators in the liver, including C-reactive protein (CRP), serum amyloid A (SAA), haptoglobin (Hp), interferon-α (IFN-α), IFN-γ, tumour necrosis factor-α (TNF-α), interleukin (IL)-1β, IL-6, IL-10 and IL-18, as well as with the presence of Salmonella spp., Lawsonia intracellularis, Brachyspira spp., enterotoxigenic Escherichia coli, methicillin-resistant Staphylococcus aureus, swine influenza virus, and porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) in nursery pigs (n=74) from commercial farms (n=4). Gene expression was quantified using reverse transcription quantitative-PCR (RT-qPCR) and the data were modelled using logistic regression methods. Pigs with elevated IGF-1 expression were less likely to have increased expression of TNF-α (odds ratio (OR)=0.14, P<0.01) and IL-18 (OR=0.19, P<0.05), and less likely to be colonized with PRRSV (OR=0.03, P<0.01). Pigs with increased expression of IGFBP-3 were more likely to have elevated IL-6 expression (OR=8.5, P<0.05). It was also observed that IGFBP-3 and IGF-1 were significantly associated when Hp expression was low (OR=30, P<0.05), but this association was not significant when Hp expression was high (P=0.54). Pigs with increased expression of GHR were less likely to have elevated expression of SAA (OR=0.01, P<0.05) and IL-1β (OR=0.03, P<0.05), but more likely to have increased expression of CRP (OR=290, P<0.01). Overall, there appears to be an inverse association between the hepatic expression of the IGF system (IGF-1, IGFBP-3, GHR) and certain cytokines (IL-1β, IL-18, TNF-α) and acute-phase proteins (SAA, Hp).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».