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Enregistrement W2320852981 · doi:10.1139/w2012-099

An investigation into plasmolysis in the oomycete<i>Achlya bisexualis</i>reveals that membrane–wall attachment points are sensitive to peptides containing the sequence RGD and that cell wall deposition can occur despite retraction of the protoplast

2012· article· en· W2320852981 sur OpenAlexvenueno aff
Kenny Chitcholtan, Elisa D. Harris, YuPing Yu, Chad Harland, Ashley Garrill

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Canterbury
Mots-clésPlasmolysisHyphaProtoplastCell wallBiologyBiophysicsCytoplasmActinCell biologyNegative stainCytolysinBiochemistryElectron microscopeMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The structure and function of membrane-wall attachment sites in walled cells, and how these relate to animal focal adhesions, is an area that is poorly understood. In view of this, we investigated how membrane-wall attachments that form upon plasmolysis, respond to peptides that disrupt animal focal adhesions. The degree of cytoplasmic disruption during plasmolysis was also investigated. Upon hyperosmotic challenge, the protoplast in hyphae of the oomycete Achlya bisexualis typically retracted incompletely due to membrane-wall attachments. The inclusion, in the plasmolysing solution, of peptides containing the sequence RGD disrupted these attachments in a dose-dependent manner. In some hyphae, protoplast retraction stopped temporarily at attachment points - upon resumption of retraction, material was left that traced the outline of the static protoplast. Staining of this material with fluorescence brightener indicated the presence of cellulose, which suggests that wall deposition was able to occur despite plasmolysis. The F-actin cytoskeleton was disrupted during plasmolysis; peripheral F-actin staining was observed, but there was no distinct F-actin cap; staining was more diffuse; and there were fewer plaques compared with nonplasmolysed hyphae. Our data indicate that membrane-wall attachment points are sensitive to RGD-containing peptides and that wall deposition continues despite protoplast retraction and F-actin disruption.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)low
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)high
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil0,973

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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