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Enregistrement W2321059489 · doi:10.5740/jaoacint.govval08

DuPont BAX<sup>®</sup> System PCR Assay for Genus <i>Listeria</i> 24E

2013· article· fr· W2321059489 sur OpenAlexaboutno aff
Federico Wallace

Notice bibliographique

RevueJournal of AOAC International · 2013
Typearticle
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueListeria monocytogenes in Food Safety
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésListeriaListeria monocytogenesBiologyLysisMicrobiologyEnterococcus faecalisEnterococcusFood scienceBacteriaMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The DuPontTM BAX® System PCR assay for Genus Listeria 24E using 24 LEB was assessed to detect Listeria spp. from food and stainless steel surfaces. The assay protocol used in these studies includes test kit lysis reagents that differ from those used in previous BAX System PCR assays (and are similar to those in the BAX System reverse-transcriptase PCR test kit for Listeria spp.) and a new proprietary enrichment medium optimized for use with this test kit. The genomic target for PCR in the Genus Listeria 24E assay is the same as that used in the previously-validated BAX System PCR assay for Genus Listeria (AOAC-RI Performance Tested MethodSM 030502), but the redesign of the test kit and new medium allow for faster target cell growth, a more quantitative lysis of enriched cells and a faster time to result. Five foods—liver paté, hot dogs, raw fermented sausage, sliced deli turkey, and sliced deli ham—and one environmental surface type, stainless steel, were simultaneously analyzed with the BAX System Q7 instrument and the Health Canada MFHPB-30 method for detecting Listeria spp. One food type, hot dogs, was artificially inoculated with L. innocua and Enterococcus faecalis. The environmental surfaces were co-inoculated with both L. monocytogenes and E. faecalis; all the other matrixes were inoculated with a single strain of L. monocytogenes. No significant differences were found in method performance when the test method was compared with the reference method.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,065

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0190,014

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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