MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2321105108 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-241

Abstract 241: Transcription factor RBP-J-mediated signaling regulates basal cell carcinoma growth

2011· article· en· W2321105108 sur OpenAlexaff
Mei Yu, David Zloty, Robert H. Bell, Anne Haegert, Nicholas Carr, Jerry Shapiro, Bryce J. Cowan, Larry Warshawski, Kevin J. McElwee

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueKruppel-like factors research
Établissements canadiensVancouver General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNotch signaling pathwayBiologyTranscription factorCyclin-dependent kinase 8JAG1Cancer researchCarcinogenesisSignal transductionBasal cell carcinomaCell biologyNotch proteinsNUMBGeneInternal medicineGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Hair follicles (HF) and basal cell carcinomas (BCCs) can be regarded as ordered and disordered skin appendages respectively. They may utilize similar molecular mechanisms of growth. We examined the similarities and differences in gene expression between BCCs and HFs to define common and unique signaling pathways that distinguish an ordered skin appendage from a disordered skin growth. Nodular BCCs, non-follicular skin epithelium, and HF between the sebaceous gland and bulb region were microdissected and examined using microarrays. Selected genes were validated using quantitative PCR, immunohistochemistry and in vitro studies. Two differentially expressed gene sets were identified by significance analysis of microarray (SAM) in BCC and HF versus skin epithelium respectively. Subsequently, multiple signaling pathway analyses were conducted. The results indicated that Notch and Hedgehog signaling pathways were active in the growth of both HF and BCCs. However, Notch signaling, including tumor suppressor genes NOTCH1, NOTCH2, ligands JAG1, JAG2, signaling inhibitor NUMB, and downstream Notch pathway genes DTX1, DTX2, RBP-J, LFNG, HR, and HES7, all showed significant differential expression in BCCs compared to HF. The data suggests downstream gene expression in the Notch signaling pathway is suppressed in BCCs. We tested the effect of transcription factor RBP-J and found transcription factor RBP-J-mediated signaling suppresses BCC cell growth and induces cell apoptosis in vitro. Our data suggest that RBP-J serves as a tumor suppressor in BCC and BCCs deficient in RBP-J lose tumor repression activity. Modulation of the Notch pathway may be a focus for the development of BCC treatments. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 241. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-241

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer ResearchMême sujetKruppel-like factors researchTravaux en français237 207