Abstract 241: Transcription factor RBP-J-mediated signaling regulates basal cell carcinoma growth
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Hair follicles (HF) and basal cell carcinomas (BCCs) can be regarded as ordered and disordered skin appendages respectively. They may utilize similar molecular mechanisms of growth. We examined the similarities and differences in gene expression between BCCs and HFs to define common and unique signaling pathways that distinguish an ordered skin appendage from a disordered skin growth. Nodular BCCs, non-follicular skin epithelium, and HF between the sebaceous gland and bulb region were microdissected and examined using microarrays. Selected genes were validated using quantitative PCR, immunohistochemistry and in vitro studies. Two differentially expressed gene sets were identified by significance analysis of microarray (SAM) in BCC and HF versus skin epithelium respectively. Subsequently, multiple signaling pathway analyses were conducted. The results indicated that Notch and Hedgehog signaling pathways were active in the growth of both HF and BCCs. However, Notch signaling, including tumor suppressor genes NOTCH1, NOTCH2, ligands JAG1, JAG2, signaling inhibitor NUMB, and downstream Notch pathway genes DTX1, DTX2, RBP-J, LFNG, HR, and HES7, all showed significant differential expression in BCCs compared to HF. The data suggests downstream gene expression in the Notch signaling pathway is suppressed in BCCs. We tested the effect of transcription factor RBP-J and found transcription factor RBP-J-mediated signaling suppresses BCC cell growth and induces cell apoptosis in vitro. Our data suggest that RBP-J serves as a tumor suppressor in BCC and BCCs deficient in RBP-J lose tumor repression activity. Modulation of the Notch pathway may be a focus for the development of BCC treatments. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 241. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-241
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».