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Enregistrement W2321617147 · doi:10.1021/bi301532c

Lipid Bilayer Properties Control Membrane Partitioning, Binding, and Transport of P-Glycoprotein Substrates

2012· article· en· W2321617147 sur OpenAlexaff
Adam Clay, Frances J. Sharom

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLipid bilayerChemistryBilayerBiophysicsPhospholipidLipid bilayer phase behaviorMembraneATP-binding cassette transporterBiological membraneBiochemistryTransporterBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ABC protein P-glycoprotein (Pgp or ABCB1) is a multidrug efflux pump capable of transporting many structurally diverse substrates from within the lipid bilayer. Previous studies have demonstrated the importance of the membrane in modulating Pgp function, but few have quantified these effects. We employed purified Pgp reconstituted into phospholipid bilayers with defined gel to liquid-crystalline melting transitions to investigate the effect of membrane environment on the transporter and three of its substrates. Equilibrium dialysis measurements indicated that Hoechst 33342, LDS-751, and MK-571 partitioned much more readily into liquid-crystalline phase bilayers than into gel phase bilayers. However, drug binding affinities revealed that Pgp bound the three substrates more tightly when the lipid bilayer was in the gel phase. The binding affinity of the transporter for substrates within the bilayer was low, in the millimolar range, suggesting that it interacts with them weakly. Thermodynamic analysis revealed that both drug-Pgp and drug-lipid interactions contribute to binding affinity. The kinetics of LDS-751 and Hoechst 33342 transport by reconstituted Pgp was monitored using a real-time fluorescence-based assay to obtain apparent turnover frequencies. Transport rates were found to be sensitive to both drug structure and lipid environment. Arrhenius and transition state analysis of transport rates suggested that the rate of drug transport depends on both the affinity of Pgp for substrate and protein conformational changes. Transport rates did not appear to be limited exclusively by the rate of ATP hydrolysis and may be partially controlled by the rate of drug dissociation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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