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Enregistrement W2321756359 · doi:10.2174/2212796811105020090

RNA Metabolism in Neurodegenerative Disease

2011· article· en· W2321756359 sur OpenAlexaff
Kathryn Volkening, Michael J. Strong

Notice bibliographique

RevueCurrent Chemical Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensRobarts Clinical Trials
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRNABiologyAmyotrophic lateral sclerosisSpinocerebellar ataxiaRNA-binding proteinMyotonic dystrophyNeurodegenerationAtaxiaCell biologyGeneticsNeuroscienceDiseasePathologyMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RNA metabolism is a vital process through which RNA is produced, transported, regulated, stored, and translated or degraded. Recently, the discoveries of mutations in key RNA binding proteins involved in several human neuronal based diseases have firmly placed the process of RNA metabolism as central to disease etiology. This review first recaps the process of RNA metabolism in the mammalian neuron and describes the roles of RNA granules in this process. Using the recently described alterations in TAR DNA binding protein (TDP-43) and fused in sarcoma/translocated in liposarcoma (FUS/TLS) in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontal temporal lobar degeneration (FTLD), we discuss how RNA binding protein abnormalities can affect RNA metabolism. We then discuss two additional RNA based mechanisms distinct from alterations in RNA binding protein function that impact RNA metabolism and result in disease. Cumulatively, these observations provide strong support for the hypothesis that alterations in RNA metabolism can lead to neurodegenerative disease, including ALS. Keywords: ALS, miRNA, FUS/TLS, TDP-43, myotonic dystrophy, spinal muscular atrophy, RNA metabolism, stress granule, transport granule, Neurodegenerative Disease, frontal temporal lobar degeneration, neuronal intermediate filament inclusion diseas, fragile X tremor ataxia syndrome, spinocerebellar ataxia type 8, oculopharyngeal muscular dystrophy

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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