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Enregistrement W2321814733 · doi:10.1021/es203212w

Toxicogenomic Mechanisms of 6-HO-BDE-47, 6-MeO-BDE-47, and BDE-47 in <i>E. coli</i>

2011· article· en· W2321814733 sur OpenAlexaff
Guanyong Su, Xiaowei Zhang, Hongling Liu, John P. Giesy, Michael Hon‐Wah Lam, Paul K.S. Lam, Maqsood A. Siddiqui, Javed Musarrat, Abdulaziz A. Al‐Khedhairy, Hongxia Yu

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Science & Technology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquebioluminescence and chemiluminescence research
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCytotoxicityReporter geneEC50ChemistryGeneGene expressionEscherichia coliBiologyMolecular biologyBiochemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cytotoxicity of 6-HO-BDE-47 and its two analogues, BDE-47 and 6-MeO-BDE-47, and the associated molecular mechanisms were assessed by use of a live cell reporter assay system which contains a library of 1820 modified green fluorescent protein (GFP) expressing promoter reporter vectors constructed from E. coli K12 strains. 6-HO-BDE-47 inhibited growth of E. coli with a 4 h median effect concentration (EC50) of 22.52 ± 2.20 mg/L, but neither BDE-47 nor 6-MeO-BDE-47 were cytotoxic. Thus, 6-HO-BDE-47 might serve as an antibiotic in some living organisms. Exposure to 6-HO-BDE-47 resulted in 65 (fold change >2) or 129 (fold change >1.5) genes being differentially expressed. The no observed transcriptional effect concentration (NOTEC) and median transcriptional effect concentration (TEC50) based on transcriptional end points, of 6-HO-BDE-47 were 0.0438 and 0.580 mg/L, respectively. The transcriptional responses were 514- and 39-fold more sensitive than the acute EC50 to inhibit cell growth. Most of the genes that were differentially expressed in response to 6-HO-BDE-47 were not modulated by BDE-47 or 6-MeO-BDE-47. These results suggest that cytotoxicity of 6-HO-BDE-47 to E. coli was via a mechanism that was different from that of either BDE-47 or 6-MeO-BDE-47. Gene expression associated with metabolic pathways was more responsive to 6-HO-BDE-47, which suggests that this pathway might be the primary target of this compound.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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