Abstract 2712: Identification of tumor initiating genes RPL39 and MLF2 that mediate lung metastasis through nitric oxide signaling and mesenchymal to epithelial transition.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Triple negative breast cancer (TNBC) is the most aggressive and lethal form of cancer characterized by lack of estrogen, progesterone and Her2 receptors. It is prevalent in women of African American descent, often present in younger and premenopausal women. It shows high risk of recurrence and frequently metastasizes to lungs and brain, resulting in poor overall prognosis. There is no targeted therapy for TNBC as it does not respond to hormonal therapy and is intrinsically resistance to conventional chemotherapy. It is therefore imperative to understand the mechanism of survival of these cancers and unravel its biological pathways and modes of progression. We have previously described breast cancer stem cells (BCSC) to be intrinsically resistant to treatment which is further confirmed by recent publications by other groups that describe direct functional evidence for the same. Using genomic assays, we traced a BCSC gene signature comprising of 477 genes derived from patient biopsies. On selective shRNA knockdown of these genes we identified RPL39 and MLF2 as the top two candidates that affect BCSC self-renewal. Selective siRNA knockdown of RPL39 and MLF2 in human cancer xenografts, showed reduced tumor volume and lung metastases with a concomitant decrease in BCSC markers. Thus, targeting BCSCs in combination with chemotherapy should eliminate the heterogeneous populations within a tumor. Additionally, next generation RNA-seq confirmed mutations in RPL39 and MLF2 in 50% of lung metastases from breast cancer patients. In vitro and in vivo siRNA knockdown of RPL39 and MLF2 showed decrease in nitric oxide synthase, suggesting that these genes are driven by nitric oxide signaling. In conclusion this study reveals novel tumor initiating genes, RPL39 and MLF2 that target the breast cancer stem cells and also show impact on lung metastasis. Our findings enhance the understanding of treatment resistant breast cancer stem cells, the mutations that cause metastases and also lay foundation for developing new therapies for such cancers with poor prognosis. Citation Format: Bhuvanesh Dave, Sergio Granados, Junhua Mai, Dong Soon Choi, Ding Cheng Gao, Sucharita Mitra, Haifa Shen, Senthil Muthuswamy, Vivek Mittal, Mauro Ferrari, Jenny Chang. Identification of tumor initiating genes RPL39 and MLF2 that mediate lung metastasis through nitric oxide signaling and mesenchymal to epithelial transition. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 2712. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-2712
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».