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Enregistrement W2321848425 · doi:10.1021/ac301691r

Reactivity of β-Methylamino-<scp>l</scp>-alanine in Complex Sample Matrixes Complicating Detection and Quantification by Mass Spectrometry

2012· article· en· W2321848425 sur OpenAlexaff
William B. Glover, Caitlyn M Liberto, W. Stephen McNeil, Sandra Anne Banack, Paul R. Shipley, Susan J. Murch

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensOkanagan University CollegeUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryAdductMass spectrometryDerivatizationElectrospray ionizationFragmentation (computing)Inductively coupled plasma mass spectrometryChemical ionizationChromatographyIonizationIonOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

β-methylamino-l-alanine (BMAA) is a naturally occurring nonprotein amino acid originally discovered in cycad seeds and traditional foods of the Chamorro people of Guam. Recent research has implicated BMAA as a potential factor in neurodegenerative disease and described the production of BMAA in cyanobacteria, but conflicting results have complicated the interpretation of data. We hypothesized that the reactivity of BMAA with metal ions in the sample matrix and the formation of metal adducts in electrospray ionization mass spectrometry (MS) analysis confound results. Dilute solutions of TCA, MgCl(2), NaCl, CuCl(2), ZnCl(2) (0.01 M), or artificial ocean water (Instant Ocean, 3.5 g/L) reduced the signal attributable to the BMAA M + H(+) peak by 78-99.7%. The degree of adduct formation was significantly affected by MS settings such as induction voltage. A number of the detected ion peaks in BMAA standards were consistent with the formation of metal-BMAA complexes in addition to the adduct formation. A standard of Zn(BMAA)(2) was synthesized, and the effects of sample preparation, derivatization, column chromatography, pH, and interactions with serine were determined. Together, these data demonstrate that sample matrix, formation of adducts, and mass spectrometry settings complicate analysis of BMAA, that analysis by detection of the parent ion and daughter ion fragmentation patterns are highly susceptible to false negative findings, and that failure to detect BMAA cannot be considered proof of absence of the compound.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,703

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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