The Structures and Stabilities of the Complexes of Biologically Available Ligands with Fe(III)−Porphine: An Ab Initio Study
Notice bibliographique
Résumé
Fe(II) porphine complexes were investigated at the “MP2/LB”//B3LYP/SB level of theory where SB and LB denote the small and large basis sets, 6-31+G(d) and 6-311+G(2df,2p), respectively. Solvation effects due to water and benzene were approximated by the IEFPCM procedure. Ligands included H2O, Cl-, and OH- and Im(imidazole), CH3NH2, (CH3)2S, CH3CO2-, CH3 S-, and CH3PhO- as models of the side chains of His, Lys, Met, Asp/Glu, Cys, and Tyr residues, respectively. Fe(II)porphine, 2, and the complexes 2(H2O), 2(Im), 2(CH3)2S), 2(CH3NH2), and 2(H2O)2 have triplet ground states. All pentacoordinated complexes of 2 with negatively charged ligands have high spin quintet ground states, while all hexacoordinated complexes with at least one Im ligand have low spin singlet ground states. With the exception of 2(Im)2 and 2(Im)((CH3)2S), no hexacoordinated complexes are stable in water or benzene.Redox properties are sensitive to the nature of the environment and the ligand(s)attached to the iron center. With the exception of the parent system, 2+/2, all complexes are predicted to have a negative reduction potential relative to the standard hydrogen electrode in water. With neutral ligand(s),the reduction potential is higher in the nonpolar environment. The opposite is true with negatively charged ligands. The redox activity of cytochromes, peroxidases, and catalases is discussed in the context of the model parent systems.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».