Abstract 937: Nicotinic acetylcholine receptor polymorphisms, secondhand smoke and lung cancer risk
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction: Passive or secondhand smoke (SHS) exposure is an independent risk factor for adult non-small cell lung cancer (NSCLC). In 2008, three genome wide association studies (GWAS) identified a locus on chromosome region 15q24-25.1 that was strongly associated with lung cancer. In this study, we assessed the interaction of the two most significant single nucleotide polymorphisms (SNPs) reported (rs8034191, rs1051730) with SHS on lung cancer risk. We hypothesize that after adjusting for active cigarette smoking, individuals with the risk alleles and the highest cumulative exposure to SHS are at the greatest risk of lung cancer. Methods: This study population is derived from a large ongoing case control study evaluating the molecular epidemiology of lung cancer, which began in 1992 at the Massachusetts General Hospital. The polymorphisms were genotyped by the 5V nuclease assay (Taqman) using the ABI Prism 7900HT Sequence Detection System (Applied Biosystems, Foster City, CA). Interviewer-administered questionnaires collected information on demographics, and detailed smoking histories from each subject. Second hand smoke exposure duration and frequency was self-reported for three different activities (leisure, work and at home). The cumulative SHS exposure was the sum of all durations multiplied by their frequency weight. We used the co-dominant genetic model for individual SNPs, controlling for age, gender, pack years, years since smoking cessation and smoking status. We tested for interaction using the Likelihood Ratio Test by incorporating cross product interaction terms of indicator variables for each SNP and quartiles of cumulative exposure. Results: A total of 2071 cases and 1506 controls were analyzed. Among cases, exposure to SHS at home 1924(93%), work 1727 (83%), leisure 1791 (86%); among controls 1328 (88%), 1044 (69%) and 1233 (82%) respectively. In stratified analysis, for study participants in the highest quartile of cumulative SHS exposure and comparing the homozygous variant to the wildtype, the adjusted odds ratio (AOR) for lung cancer was 1.55 (0.99-2.44) (rs8034191) and 1.66 (1.05-2.62) (rs1051730). In the lowest quartile of SHS exposure the corresponding results were 0.94 (0.47-1.89) (rs8034191) and 0.91(0.45-1.84) (rs1051730). There was no evidence for gene-SHS interaction. Conclusion: Our results indicate that secondhand smoke does not modify the association of rs1051730 and rs8034191 with non-small cell lung cancer. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 937.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,013 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».