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Enregistrement W2322458842 · doi:10.1139/cjm-2013-0166

Molecular factors that are associated with early developmental arrest of intraerythrocytic<i>Plasmodium falciparum</i>

2013· article· en· W2322458842 sur OpenAlexvenueno aff
Hiroko Asahi, Mohammed Essa Marghany Tolba, M. Tanabe, Hiroshi Ohmae

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWorld Health Organization
Mots-clésBiologySchizogonyPlasmodium falciparumParasite hostingCell biologyTranscriptomeGeneMalariaBiochemistryGene expressionImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malaria continues to be a devastating disease. We investigated the factors that control intraerythrocytic development of the parasite Plasmodium falciparum by using a chemically defined medium (CDM) containing non-esterified fatty acid(s) (NEFA) and phospholipids with specific fatty acid moieties, to identify substances crucial for parasite development. Different NEFAs in the CDM played distinct roles by altering the development of the parasite at various stages, with effects ranging from complete growth to growth arrest at the ring stage. We used genome-wide transcriptome profiling to identify genes that were differentially expressed among the different developmental stages of the parasite, cultured in the presence of various NEFAs. We predicted 26 transcripts that were associated with the suppression of schizogony, of which 5 transcripts, including merozoite surface protein 2, a putative DEAD/DEAH box RNA helicase, serine repeat antigen 3, a putative copper channel, and palmitoyl acyltransferase, were particularly associated with blockage of trophozoite progression from the ring stage. Furthermore, the involvement of copper ions in developmental arrest was detected by copper-ion-chelating methods, implying a critical function of copper homeostasis in the early growth stage of the parasite. These results should help to elucidate the mechanisms behind the development of P. falciparum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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