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Enregistrement W2322610257 · doi:10.1021/bi301693g

Assembly of Hemoglobin from Denatured Monomeric Subunits: Heme Ligation Effects and Off-Pathway Intermediates Studied by Electrospray Mass Spectrometry

2013· article· en· W2322610257 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryGlobinHemeDenaturation (fissile materials)MonomerProtein subunitYield (engineering)Protein foldingHemoglobinHemeproteinElectrospray ionizationBiophysicsNeuroglobinProtein structureCrystallographyMass spectrometryBiochemistryChromatographyOrganic chemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The oxygen binding properties of vertebrate hemoglobins (Hb) have been explored in great detail. In contrast, folding and assembly of these heterotetrameric protein complexes remain poorly understood. Similar to investigations of other multisubunit systems, in vitro Hb refolding experiments are often plagued by aggregation. Here we monitor the refolding of bovine Hb by electrospray mass spectrometry (ESI-MS). This technique allows the observation of coexisting subunit combinations, heme binding states, and protein conformers. Exposure to 40% acetonitrile at pH 10 causes Hb disassembly and extensive subunit unfolding. Hb reassembly is triggered by solvent exchange. Experiments conducted at room temperature provide a low metHb refolding yield. A significantly improved yield is achieved by lowering the temperature to 4 °C and by supplementing the protein solution with KCN prior to denaturation. Comparative studies under "low-yield" and "high-yield" conditions report on the interplay between folding and misfolding. The tendency of β-globin to undergo aggregation is found to be the key impediment to the formation of native Hb. The α/β imbalance generated in this way favors the formation of non-native α-globin assemblies. Our data imply that hemin dicyanide formed in the presence of KCN remains weakly bound to denatured β-globin, thereby counteracting aggregation, such that the refolding yield is enhanced. In the absence of aggregation-related interference, Hb assembly follows a symmetric pathway. Monomeric α- and β-globin adopt a compact conformation upon heme binding. Heme-bound monomers then form heterodimers, and ultimately heterodimer association results in native Hb. This work highlights the utility of time-resolved ESI-MS investigations for interrogating the kinetic competition between on-pathway events and aberrant side reactions during the self-assembly of biomolecular complexes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle