Fungal nomenclature 3. A critical response to the 'Amsterdam Declaration'
Notice bibliographique
Résumé
Numerous taxonomists and monographers of fungi are objecting an enforced unitary nomenclature for ascomycetes and basidiomycetes. Proposals 297 and subsequent ones by Redhead et al. (2010) and the “Amsterdam Declaration” (AD) demand more or less drastic and not necessarily efficient changes into this direction. Three groups of arguments in the AD are refuted: 1. The identification of organisms exclusively based on gene sequences is prone to errors and only a minority of the named fungi has been thoroughly studied so far with molecular methods. 2. There is no need for a mycological Code separate from the botanical one. Where taxonomy demands, special rules for Fungi have already been defined. The registration of taxonomic novelties required for valid publication is supported, but without MycoBank being entitled to make taxonomic statements. 3. Deletion of Article 59 is not possible without chaotic consequences. The mechanism of teleotypification alone does not lead to phylogenetically supported genera. Even after introducing a 'one fungus – one name' rule, mycologists will need to understand the so far prevailing system of dual nomenclature when screening the taxonomic literature. Objections to the recommendations of the AD include: A selection of generic names among either teleomorph-typified or anamorph-typified genera according to priority contravenes the time-honored rule of precedence of teleomorph-typified names and would make many crucial teleomorph genera unavailable. – A rule that mycologists, who first choose the generic name to be adopted, would have to be followed and this choice has to be registered will be a serious source of conflicts among mycologists. – More weight will be given to the ICTF, an organization dealing mainly with economically important fungi. We maintain that questions of fungal nomenclature must continue to be handled by the Nomenclature Committee for Fungi (NCF)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,032 | 0,076 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,006 | 0,014 |
| Communication savante | 0,016 | 0,010 |
| Science ouverte | 0,006 | 0,007 |
| Intégrité de la recherche | 0,021 | 0,051 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,011 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».