The Influence of CTGF Single-Nucleotide Polymorphisms on Outcomes in Crohn's Disease
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To examine the association between single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in CTGF (connective tissue growth factor) and patient outcomes after terminal ileal resection for Crohn's disease. BACKGROUND: The primary indication for intestinal resection in Crohn's disease is fibrostenotic terminal ileal disease. CTGF is a cytokine overexpressed in the intestine of patients with Crohn's disease that influences outcomes in other disease processes. METHODS: DNA was extracted from formalin-fixed, paraffin-embedded tissue from 147 patients with Crohn's disease who had undergone terminal ileal resection between 1981 and 2009. Genotyping was performed for 4 CTGF SNPs (rs9402373, rs12526196, rs6918698, and rs9399005), which modulate nuclear factor binding and CTGF production, and a smad3 SNP (rs17293632) involved in the CTGF pathway. Patients were phenotyped using the Montreal Disease Classification. RESULTS: Sixty-seven of 147 patients (45.6%) were male; the mean age at diagnosis was 30.3 ± 12.6 years and the mean follow-up duration was 8.3 ± 7.1 years. Genotype-phenotype analysis demonstrated that the rs6918698GG genotype was associated with an older age of disease onset [>40 years; 30.6% vs 13.2%; odds ratio (OR): 2.891; 95% confidence interval (CI): 1.170-7.147). The rs9402373CC genotype was positively associated with type B1 disease (50.7% vs 26.3%; OR: 2.876; 95% CI: 1.226-6.743) and negatively associated with B2 disease (37.0% vs 65.0%; OR: 0.317; 95% CI: 0.144-0.699). None of the 5 SNPs assessed influenced clinical or surgical recurrence of Crohn's disease after intestinal resection. On multivariate analysis, male sex odds ratio (OR): 0.235; 95% CI: 0.073-0.755; P = 0.015] and never having smoked tobacco (OR: 0.249; 95% CI: 0.070-0.894; P = 0.033) reduced the risk, whereas having a prior appendectomy increased the risk (OR: 5.048; 95% CI: 1.632-15.617; P = 0.005) of surgical recurrence. CONCLUSIONS: These data implicate the rs6918698GG genotype with an age of disease onset of greater than 40 years in Crohn's disease whereas the rs9402373CC genotype is associated with a nonstricturing, nonpenetrating disease phenotype. CTGF SNPs do not influence the rate of recurrence after terminal ileal resection for Crohn's disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».