Further refinements of next-generation force fields — Nonempirical localization of off-centered points in molecules
Notice bibliographique
Résumé
In the present work, we investigate different possibilities for the nonempirical localization of nonatomic centers within the context of the design of new generation polarizable force fields. To do so, the positions of electron localization function (ELF) and electron pair localization function (EPLF) attractors and of Boys orbital centroids are determined for a set of thirteen saturated and conjugated biologically relevant molecules. We consider the similarities and differences in the representations of localized lone pairs and π delocalized systems by these approaches, as well as the effects of the basis sets and of the level of quantum chemistry (QC). All three methods give consistent results upon dealing with the localized lone pairs. Concerning aromatic systems, whereas ELF and EPLF methods give mutually consistent results, the Boys scheme breaks the symmetry by alternating the electron distributions along the C–C bonds providing a different distribution of off-centered points. We then investigate the influence of lone pair localization in the water model of the Gaussian electrostatic model/sum of interactions between fragments ab initio computed (GEM/SIBFA) polarizable force field, which embodies an explicit representation of the lone pairs. This is done, in a series of mono- and poly-hydrated Zn(II) complexes, by comparing the overlap-dependent repulsion (E rep ) and charge-transfer (E ct ) contributions to their QC counterparts. We resort to either the current GEM/SIBFA water lone pair internal coordinates or to the ones derived from the previously mentioned localization procedures. The latter enables closer reproductions by E rep and E ct (GEM/SIBFA) of their exchange repulsion (E exch ) and E ct QC counterparts. The present preliminary results show that QC localization procedures can be used to derive accurate, nonempirical positions for off-centered points intervening in the formulation of the overlap-dependent contributions of next-generation polarizable force fields.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».