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Enregistrement W2323113038 · doi:10.1097/nen.0000000000000190

Effects of Postmortem Interval on Biomolecule Integrity in the Brain

2015· article· en· W2323113038 sur OpenAlexafffund
Corina Nagy, Marissa Maheu, Juan Pablo López, Kathryn Vaillancourt, Cristiana Cruceanu, Jeffrey Gross, Mitchell Arnovitz, Naguib Mechawar, Gustavo Turecki

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuropathology & Experimental Neurology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesMcGill University
Mots-clésPostmortem ChangesHousekeeping geneHistoneEpigeneticsmicroRNABrain tissueBiologyRNAPathologyHuman brainMedicineBioinformaticsGene expressionGeneNeuroscienceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Postmortem brain research is invaluable to the study of neurologic and neuropsychiatric disorders, including Alzheimer disease, schizophrenia, and major depression. A major confounder in molecular studies using human brain tissue is postmortem interval (i.e. the amount of time between a subject's death and processing of tissue). We examined the integrity of biomolecules that were of interest to molecular studies of neurologic disorders, including RNA, microRNA, histone modifications, and proteins, at various postmortem intervals in an animal model to assess their robustness and suitability for experimentation. Sprague-Dawley rats were selected as model and subjected to 2 conditions: a variable postmortem interval at room temperature and a fixed time of 24 hours at 4°C, which simulates the period commonly spent in the morgue before brain collection. Eight time points were investigated. MicroRNA was impressively resistant to postmortem intervals; methylated histone modifications showed a threshold between 72 and 96 hours, mirroring results from histone proteins at 72 hours. RNA degradation was transcript-specific, with housekeeping genes being more robust than genes with lower expression. Our results suggest that molecules commonly investigated in genetic and epigenetic studies were highly stable through the postmortem intervals investigated. These results support the continued use of postmortem tissue for neuropsychiatric research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,433

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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