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Enregistrement W2323138742 · doi:10.1139/cjm-2013-0062

The GacS-regulated sigma factor RpoS governs production of several factors involved in biocontrol activity of the rhizobacterium <i>Pseudomonas chlororaphis</i> O6

2013· article· en· W2323138742 sur OpenAlexvenueno aff
Sang A Oh, Ji Soo Kim, Song Hee Han, Ju Yeon Park, Christian O. Dimkpa, Chet Edlund, Anne J. Anderson, Young Cheol Kim

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Research Foundation of KoreaFonds National de la Recherche LuxembourgKorea Basic Science InstituteUtah State University
Mots-clésrpoSPseudomonas chlororaphisSigma factorBiologyMutantMicrobiologyOomycetePseudomonasGeneticsGeneBacteriaPromoterPathogenGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas chlororaphis O6 possesses many beneficial traits involved in biocontrol of plant diseases. In this paper, we examined the effect of a mutation in rpoS encoding a stress-related alternative sigma factor to better understand the regulation of these traits. Biochemical studies indicated that production of acyl homoserine lactones was altered and phenazine was increased in the P. chlororaphis O6 rpoS mutant. The rpoS mutation reduced hydrogen cyanide levels, but the rpoS mutant still displayed a level of in vitro antifungal activity against Fusarium graminearum and Alternaria alternata. Tomato root colonization by the rpoS mutant was lower than that by the wild type at 5, 7, and 13 days after inoculation. The rpoS mutant was less effective than the wild type in induction of systemic resistance to two foliar pathogens after root inoculation of the tomato plants. Our findings demonstrate that the stationary-phase sigma factor RpoS regulates production of several key factors involved in the biocontrol potential of P. chlororaphis O6, some independently of the global regulator GacS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,618
Score d'incertitude au seuil0,969

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,178
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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