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Enregistrement W2323533331 · doi:10.1242/bio.017400

<i>C. elegans</i>flavin-containing monooxygenase-4 is essential for osmoregulation in hypotonic stress

2016· article· en· W2323533331 sur OpenAlexfundno aff
Nisha Hirani, Marcel Westenberg, Paul T. Seed, Mark I.R. Petalcorin, Colin T. Dolphin

Notice bibliographique

RevueBiology Open · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of OxfordKing's College LondonSimon Fraser UniversityUniversity College LondonWellcome TrustUniversity of LeedsOhio State UniversityMassachusetts General Hospital
Mots-clésBiologyOsmoregulationOsmolyteExcretory systemTonicityCell biologyOsmotic shockBiochemistryAnatomyEcologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studies in Caenorhabditis elegans have revealed osmoregulatory systems engaged when worms experience hypertonic conditions, but less is known about measures employed when faced with hypotonic stress. Inactivation of fmo-4, which encodes flavin-containing monooxygenase-4, results in dramatic hypoosmotic hypersensitivity; worms are unable to prevent overwhelming water influx and swell rapidly, finally rupturing due to high internal hydrostatic pressure. fmo-4 is expressed prominently in hypodermis, duct and pore cells but is excluded from the excretory cell. Thus, FMO-4 plays a crucial osmoregulatory role by promoting clearance of excess water that enters during hypotonicity, perhaps by synthesizing an osmolyte that acts to establish an osmotic gradient from excretory cell to duct and pore cells. C. elegans FMO-4 contains a C-terminal extension conserved in all nematode FMO-4s. The coincidently numbered human FMO4 also contains an extended C-terminus with features similar to those of FMO-4. Although these shared sequence characteristics suggest potential orthology, human FMO4 was unable to rescue the fmo-4 osmoregulatory defect. Intriguingly, however, mammalian FMO4 is expressed predominantly in the kidney - an appropriate site if it too is, or once was, involved in osmoregulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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